RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486514.5

BNC2-209, Transcript of basonuclin 2, humanhuman

TSL 2

Gene BNC2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC2-209ENST00000486514 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa29.59■■■□□ 2.33
BNC2-209ENST00000486514 GPR142Q7Z601 462 aa29.59■■■□□ 2.33
BNC2-209ENST00000486514 USP6NLQ92738 828 aa29.59■■■□□ 2.33
BNC2-209ENST00000486514 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
BNC2-209ENST00000486514 ANKLE1Q8NAG6 615 aa29.58■■■□□ 2.33
BNC2-209ENST00000486514 VCAM1P19320 739 aa29.57■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 GUCY1A2P33402 732 aa29.57■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 PDE3AQ14432 1141 aa29.57■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 CCL14Q16627 93 aa29.57■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 MORN1Q5T089 497 aa29.57■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa29.57■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 BCL11AQ9H165 835 aa29.57■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 COG6Q9Y2V7 657 aa29.57■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 ZNF532Q9HCE3 1301 aa29.56■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa29.56■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 USP17L15C9J2P7 530 aa29.56■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 USP17L13C9JLJ4 530 aa29.56■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 USP17L11C9JVI0 530 aa29.56■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 USP17L18D6R9N7 530 aa29.56■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 USP17L22D6RA61 530 aa29.56■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 USP17L17D6RBQ6 530 aa29.56■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 USP17L19D6RCP7 530 aa29.56■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 USP17L20D6RJB6 530 aa29.56■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 GOLIM4O00461 696 aa29.56■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 GABPAQ06546 454 aa29.56■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 USP17L24Q0WX57 530 aa29.56■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 PLEKHH3Q7Z736 793 aa29.56■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 KIF1BPQ96EK5 621 aa29.56■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa29.55■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa29.55■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 OGDHLQ9ULD0 1010 aa29.55■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 USP14P54578 494 aa29.54■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 LCORLQ8N3X6 602 aa29.54■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP29.54■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 SDR42E1Q8WUS8 393 aa29.54■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 NBPF3Q9H094 633 aa29.54■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa29.54■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 RGS2P41220 211 aa29.53■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 SEPT2Q15019 361 aa29.53■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 SLFNL1Q499Z3 407 aa29.53■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 C7orf61Q8IZ16 206 aa29.53■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 CABP5Q9NP86 173 aa29.53■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 MCM9Q9NXL9 1143 aa29.53■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 STAP2Q9UGK3 403 aa29.53■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 CYP2D6P10635 497 aa29.52■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 MS4A1P11836 297 aa29.52■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 APBA2Q99767 749 aa29.52■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 C11orf49Q9H6J7 331 aa29.52■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 BTBD7Q9P203 1132 aa29.52■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 DDX19BQ9UMR2 479 aa29.52■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 DNAH12Q6ZR08 3092 aa29.51■■■□□ 2.32
BNC2-209ENST00000486514 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
BNC2-209ENST00000486514 SLC44A5Q8NCS7 719 aa29.51■■■□□ 2.31
BNC2-209ENST00000486514 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
BNC2-209ENST00000486514 A0A1W2PRG0 241 aa29.5■■■□□ 2.31
BNC2-209ENST00000486514 HMMRO75330 724 aa29.5■■■□□ 2.31
BNC2-209ENST00000486514 ARMT1Q9H993 441 aa29.5■■■□□ 2.31
BNC2-209ENST00000486514 PFASO15067 1338 aa29.49■■■□□ 2.31
BNC2-209ENST00000486514 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
BNC2-209ENST00000486514 MAP2K5Q13163 448 aa29.49■■■□□ 2.31
BNC2-209ENST00000486514 LHX8Q68G74 356 aa29.49■■■□□ 2.31
BNC2-209ENST00000486514 LBX2Q6XYB7 198 aa29.49■■■□□ 2.31
BNC2-209ENST00000486514 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
BNC2-209ENST00000486514 FLRT1Q9NZU1 646 aa29.49■■■□□ 2.31
BNC2-209ENST00000486514 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
BNC2-209ENST00000486514 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
BNC2-209ENST00000486514 CHGBP05060 677 aa29.48■■■□□ 2.31
BNC2-209ENST00000486514 CCNA1P78396 465 aa29.48■■■□□ 2.31
BNC2-209ENST00000486514 WDR78Q5VTH9 848 aa29.48■■■□□ 2.31
BNC2-209ENST00000486514 BOLA2Q9H3K6 86 aa29.48■■■□□ 2.31
BNC2-209ENST00000486514 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
BNC2-209ENST00000486514 PRKAB2O43741 272 aa29.47■■■□□ 2.31
BNC2-209ENST00000486514 RAB11FIP3O75154 756 aa29.47■■■□□ 2.31
BNC2-209ENST00000486514 DYNLL2Q96FJ2 89 aa29.47■■■□□ 2.31
BNC2-209ENST00000486514 PAG1Q9NWQ8 432 aa29.47■■■□□ 2.31
BNC2-209ENST00000486514 SMIM22K7EJ46 135 aa29.46■■■□□ 2.31
BNC2-209ENST00000486514 PTPREP23469 700 aa29.46■■■□□ 2.31
BNC2-209ENST00000486514 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa29.46■■■□□ 2.31
BNC2-209ENST00000486514 A0A1W2PPC1 479 aa29.45■■■□□ 2.31
BNC2-209ENST00000486514 MBD4O95243 580 aa29.45■■■□□ 2.31
BNC2-209ENST00000486514 SYN1P17600 705 aa29.45■■■□□ 2.31
BNC2-209ENST00000486514 ADD2P35612 726 aa29.45■■■□□ 2.31
BNC2-209ENST00000486514 CLEC10AQ8IUN9 316 aa29.45■■■□□ 2.31
BNC2-209ENST00000486514 GDF15Q99988 308 aa29.45■■■□□ 2.31
BNC2-209ENST00000486514 FRMPD3Q5JV73 1810 aa29.45■■■□□ 2.3
BNC2-209ENST00000486514 COL6A3P12111 3177 aa29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms