RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477486.1

RBMS1-211, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene RBMS1, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1-211ENST00000477486 DEFB118Q96PH6 123 aa26.56■■□□□ 1.84
RBMS1-211ENST00000477486 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa26.55■■□□□ 1.84
RBMS1-211ENST00000477486 AMOTL1Q8IY63 956 aa26.55■■□□□ 1.84
RBMS1-211ENST00000477486 TXNRD2Q9NNW7 524 aa26.55■■□□□ 1.84
RBMS1-211ENST00000477486 RBPJLQ9UBG7 517 aa26.55■■□□□ 1.84
RBMS1-211ENST00000477486 GJD2Q9UKL4 321 aa26.55■■□□□ 1.84
RBMS1-211ENST00000477486 PRKAB2O43741 272 aa26.54■■□□□ 1.84
RBMS1-211ENST00000477486 CYP2B6P20813 491 aa26.54■■□□□ 1.84
RBMS1-211ENST00000477486 SEPT2Q15019 361 aa26.54■■□□□ 1.84
RBMS1-211ENST00000477486 ACER1Q8TDN7 264 aa26.54■■□□□ 1.84
RBMS1-211ENST00000477486 NUDT12Q9BQG2 462 aa26.54■■□□□ 1.84
RBMS1-211ENST00000477486 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa26.54■■□□□ 1.84
RBMS1-211ENST00000477486 HMGCRP04035 888 aa26.53■■□□□ 1.84
RBMS1-211ENST00000477486 CYP2D6P10635 497 aa26.53■■□□□ 1.84
RBMS1-211ENST00000477486 MAPK4P31152 587 aa26.53■■□□□ 1.84
RBMS1-211ENST00000477486 ERVK-9P63128 1117 aa26.53■■□□□ 1.84
RBMS1-211ENST00000477486 ERVK-24P63145 666 aa26.53■■□□□ 1.84
RBMS1-211ENST00000477486 GPATCH3Q96I76 525 aa26.53■■□□□ 1.84
RBMS1-211ENST00000477486 C12orf42Q96LP6 360 aa26.53■■□□□ 1.84
RBMS1-211ENST00000477486 HTATIP2Q9BUP3 242 aa26.53■■□□□ 1.84
RBMS1-211ENST00000477486 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa26.53■■□□□ 1.84
RBMS1-211ENST00000477486 NAV1Q8NEY1 1877 aa26.53■■□□□ 1.84
RBMS1-211ENST00000477486 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
RBMS1-211ENST00000477486 EVX2Q03828 476 aa26.52■■□□□ 1.84
RBMS1-211ENST00000477486 GABPAQ06546 454 aa26.52■■□□□ 1.84
RBMS1-211ENST00000477486 Q3C1V9 767 aa26.52■■□□□ 1.84
RBMS1-211ENST00000477486 ECHDC1Q9NTX5 307 aa26.52■■□□□ 1.84
RBMS1-211ENST00000477486 UBE3CQ15386 1083 aa26.51■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa26.51■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 DYNLL2Q96FJ2 89 aa26.51■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 DCTPP1Q9H773 170 aa26.51■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 SWAP70Q9UH65 585 aa26.51■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa26.51■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 VCAM1P19320 739 aa26.5■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 CCNA1P78396 465 aa26.5■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 WDR78Q5VTH9 848 aa26.5■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 SLC44A5Q8NCS7 719 aa26.5■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 SOCS4Q8WXH5 440 aa26.5■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP26.5■■□□□ 1.839e-7■■■■■ 42.1
RBMS1-211ENST00000477486 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa26.5■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 H0YGN5 161 aa26.49■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 CHGBP05060 677 aa26.49■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 GUCY1A2P33402 732 aa26.49■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 PORCNQ9H237 461 aa26.49■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 USP17L12C9JPN9 530 aa26.48■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 USP17L21D6R901 530 aa26.48■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 CAPN2P17655 700 aa26.48■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 TMEM179Q6ZVK1 233 aa26.48■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 GPR142Q7Z601 462 aa26.48■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 PLEKHH3Q7Z736 793 aa26.48■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 BRCA2P51587 3418 aa26.48■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 RPTORQ8N122 1335 aa26.47■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 TRIM32Q13049 653 aa26.47■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa26.46■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 RGS2P41220 211 aa26.46■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 TRIB2Q92519 343 aa26.46■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 TANGO6Q9C0B7 1094 aa26.46■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa26.46■■□□□ 1.83
RBMS1-211ENST00000477486 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
RBMS1-211ENST00000477486 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
RBMS1-211ENST00000477486 CDK8P49336 464 aa26.45■■□□□ 1.82
RBMS1-211ENST00000477486 C12orf60Q5U649 245 aa26.45■■□□□ 1.82
RBMS1-211ENST00000477486 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa26.45■■□□□ 1.82
RBMS1-211ENST00000477486 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
RBMS1-211ENST00000477486 NR2E3Q9Y5X4 410 aa26.45■■□□□ 1.82
RBMS1-211ENST00000477486 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
RBMS1-211ENST00000477486 A0A1W2PRG0 241 aa26.44■■□□□ 1.82
RBMS1-211ENST00000477486 AKR1B1P15121 316 aa26.44■■□□□ 1.82
RBMS1-211ENST00000477486 TSHZ3Q63HK5 1081 aa26.44■■□□□ 1.82
RBMS1-211ENST00000477486 POTEEQ6S8J3 1075 aa26.44■■□□□ 1.82
RBMS1-211ENST00000477486 CCDC17Q96LX7 622 aa26.44■■□□□ 1.82
RBMS1-211ENST00000477486 HOXC10Q9NYD6 342 aa26.44■■□□□ 1.82
RBMS1-211ENST00000477486 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
RBMS1-211ENST00000477486 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa26.44■■□□□ 1.82
RBMS1-211ENST00000477486 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
RBMS1-211ENST00000477486 ATP2B2Q01814 1243 aa26.43■■□□□ 1.82
RBMS1-211ENST00000477486 COG2Q14746 738 aa26.43■■□□□ 1.82
RBMS1-211ENST00000477486 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa26.43■■□□□ 1.82
RBMS1-211ENST00000477486 SH2D4AQ9H788 454 aa26.43■■□□□ 1.82
RBMS1-211ENST00000477486 MYH7P12883 1935 aa26.43■■□□□ 1.82
RBMS1-211ENST00000477486 CNMDO75829 334 aa26.42■■□□□ 1.82
RBMS1-211ENST00000477486 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
RBMS1-211ENST00000477486 ICA1Q05084 483 aa26.42■■□□□ 1.82
RBMS1-211ENST00000477486 MORN1Q5T089 497 aa26.42■■□□□ 1.82
RBMS1-211ENST00000477486 CTR9Q6PD62 1173 aa26.42■■□□□ 1.82
RBMS1-211ENST00000477486 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
RBMS1-211ENST00000477486 KBTBD3Q8NAB2 608 aa26.42■■□□□ 1.82
RBMS1-211ENST00000477486 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
RBMS1-211ENST00000477486 BTBD7Q9P203 1132 aa26.42■■□□□ 1.82
RBMS1-211ENST00000477486 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
RBMS1-211ENST00000477486 EVI5O60447 810 aa26.41■■□□□ 1.82
RBMS1-211ENST00000477486 NECAB2Q7Z6G3 386 aa26.41■■□□□ 1.82
RBMS1-211ENST00000477486 CLEC10AQ8IUN9 316 aa26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms