RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465282.5

USP39-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 4

Gene USP39, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-211ENST00000465282 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 SH2D4AQ9H788 454 aa20.08■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 ANO2Q9NQ90 1003 aa20.08■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 SAGE1Q9NXZ1 904 aa20.08■□□□□ 0.81
USP39-211ENST00000465282 LOC285556D6RIA3 1793 aa20.08■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 PLIN4Q96Q06 1357 aa20.08■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 TSPY3P0CV98 308 aa20.07■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 TSPY8P0CW00 308 aa20.07■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 USP14P54578 494 aa20.07■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 NEDD1Q8NHV4 660 aa20.07■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.07■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 CNNM2Q9H8M5 875 aa20.07■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa20.07■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 PRDM1O75626 825 aa20.06■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 REC8O95072 547 aa20.06■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 TFAP4Q01664 338 aa20.06■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 ANKRD23Q86SG2 305 aa20.06■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 NBPF3Q9H094 633 aa20.06■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa20.06■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa20.06■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 MYH4Q9Y623 1939 aa20.06■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 TSPY2A6NKD2 308 aa20.05■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 ICA1Q05084 483 aa20.05■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.05■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 ESR2Q92731 530 aa20.05■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 PTPN18Q99952 460 aa20.05■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 CFHR5Q9BXR6 569 aa20.05■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 KRT23Q9C075 422 aa20.05■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.05■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 NYAP2Q9P242 653 aa20.05■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.05■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa20.04■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 CYP21A2P08686 494 aa20.04■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.04■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 MTMR2Q13614 643 aa20.04■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 MOGSQ13724 837 aa20.04■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 RNF20Q5VTR2 975 aa20.04■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 TBC1D10CQ8IV04 446 aa20.04■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 C12orf42Q96LP6 360 aa20.04■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 FEZ1Q99689 392 aa20.04■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 TOMM22Q9NS69 142 aa20.04■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa20.04■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 TMX2Q9Y320 296 aa20.04■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 BTBD19C9JJ37 291 aa20.03■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP20.03■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 HMGCS2P54868 508 aa20.03■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 TRDNQ13061 729 aa20.03■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 NECTIN1Q15223 517 aa20.03■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 GADL1Q6ZQY3 521 aa20.03■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 INCENPQ9NQS7 918 aa20.03■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 RNF186Q9NXI6 227 aa20.03■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 MTMR4Q9NYA4 1195 aa20.03■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa20.03■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 TTLL1O95922 423 aa20.02■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 CCDC178Q5BJE1 867 aa20.02■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 FAM47AQ5JRC9 791 aa20.02■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 SIAH1Q8IUQ4 282 aa20.02■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 ACER1Q8TDN7 264 aa20.02■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 LPAR1Q92633 364 aa20.02■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 MKL1Q969V6 931 aa20.02■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 CEP95Q96GE4 821 aa20.02■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 TACC3Q9Y6A5 838 aa20.02■□□□□ 0.8
USP39-211ENST00000465282 TRPA1O75762 1119 aa20.01■□□□□ 0.79
USP39-211ENST00000465282 GPAT2Q6NUI2 795 aa20.01■□□□□ 0.79
USP39-211ENST00000465282 TTC14Q96N46 770 aa20.01■□□□□ 0.79
USP39-211ENST00000465282 PNMA3Q9UL41 463 aa20.01■□□□□ 0.79
USP39-211ENST00000465282 A0A1W2PRG0 241 aa20■□□□□ 0.79
USP39-211ENST00000465282 PDHXO00330 501 aa20■□□□□ 0.79
USP39-211ENST00000465282 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
USP39-211ENST00000465282 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
USP39-211ENST00000465282 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
USP39-211ENST00000465282 NOVP48745 357 aa20■□□□□ 0.79
USP39-211ENST00000465282 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
USP39-211ENST00000465282 IQCA1Q86XH1 822 aa20■□□□□ 0.79
USP39-211ENST00000465282 FAM43AQ8N2R8 423 aa20■□□□□ 0.79
USP39-211ENST00000465282 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa20■□□□□ 0.79
USP39-211ENST00000465282 GOPCQ9HD26 462 aa20■□□□□ 0.79
USP39-211ENST00000465282 EMILIN3Q9NT22 766 aa20■□□□□ 0.79
USP39-211ENST00000465282 NEDD4P46934 1319 aa20■□□□□ 0.79
USP39-211ENST00000465282 SLC27A2O14975 620 aa19.99■□□□□ 0.79
USP39-211ENST00000465282 ATP2B2Q01814 1243 aa19.99■□□□□ 0.79
USP39-211ENST00000465282 TSGA10IPQ3SY00 556 aa19.99■□□□□ 0.79
USP39-211ENST00000465282 CREB3L3Q68CJ9 461 aa19.99■□□□□ 0.79
USP39-211ENST00000465282 NCOA7Q8NI08 942 aa19.99■□□□□ 0.79
USP39-211ENST00000465282 VCPKMTQ9H867 229 aa19.99■□□□□ 0.79
USP39-211ENST00000465282 IL17RBQ9NRM6 502 aa19.99■□□□□ 0.79
USP39-211ENST00000465282 CLIP2Q9UDT6 1046 aa19.99■□□□□ 0.79
USP39-211ENST00000465282 B4E1Z4 1266 aa19.98■□□□□ 0.79
USP39-211ENST00000465282 E7EWF7 191 aa19.98■□□□□ 0.79
USP39-211ENST00000465282 KDM4AO75164 1064 aa19.98■□□□□ 0.79
USP39-211ENST00000465282 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms