RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453996.6

CTU2-202, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTU2, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-202ENST00000453996 MAP3K14Q99558 947 aa24.79■■□□□ 1.56
CTU2-202ENST00000453996 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CTU2-202ENST00000453996 GJB4Q9NTQ9 266 aa24.79■■□□□ 1.56
CTU2-202ENST00000453996 LTBP3Q9NS15 1303 aa24.79■■□□□ 1.56
CTU2-202ENST00000453996 STX8Q9UNK0 236 aa24.78■■□□□ 1.56
CTU2-202ENST00000453996 ELP1O95163 1332 aa24.78■■□□□ 1.56
CTU2-202ENST00000453996 PLEKHA8P1O95397 391 aa24.77■■□□□ 1.56
CTU2-202ENST00000453996 KIF5BP33176 963 aa24.77■■□□□ 1.56
CTU2-202ENST00000453996 UBE2HP62256 183 aa24.77■■□□□ 1.56
CTU2-202ENST00000453996 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CTU2-202ENST00000453996 TCP10Q12799 353 aa24.77■■□□□ 1.56
CTU2-202ENST00000453996 KRT40Q6A162 431 aa24.77■■□□□ 1.56
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CTU2-202ENST00000453996 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CTU2-202ENST00000453996 CFAP45Q9UL16 551 aa24.77■■□□□ 1.56
CTU2-202ENST00000453996 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CTU2-202ENST00000453996 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CTU2-202ENST00000453996 SPDYE2BA6NHP3 402 aa24.77■■□□□ 1.56
CTU2-202ENST00000453996 SPDYE6P0CI01 402 aa24.77■■□□□ 1.56
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CTU2-202ENST00000453996 FUT2Q10981 343 aa24.77■■□□□ 1.56
CTU2-202ENST00000453996 ATL3Q6DD88 541 aa24.77■■□□□ 1.56
CTU2-202ENST00000453996 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
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CTU2-202ENST00000453996 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CTU2-202ENST00000453996 UBE2Q2LH0YL09 131 aa24.76■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 ENTPD3O75355 529 aa24.76■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 GUCY1A2P33402 732 aa24.76■■□□□ 1.55
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CTU2-202ENST00000453996 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.76■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 SPATA32Q96LK8 384 aa24.76■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 TMEM47Q9BQJ4 181 aa24.76■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 TAOK2Q9UL54 1235 aa24.76■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 SHMT1P34896 483 aa24.75■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 CIAPIN1Q6FI81 312 aa24.75■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 TMOD2Q9NZR1 351 aa24.75■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 CEP95Q96GE4 821 aa24.75■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 SPON1Q9HCB6 807 aa24.75■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 PI4KBQ9UBF8 816 aa24.75■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa24.75■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 AKR1B1P15121 316 aa24.74■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 NOVP48745 357 aa24.74■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 GRM4Q14833 912 aa24.74■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 ATRNL1Q5VV63 1379 aa24.74■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 TOP1P11387 765 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 TNIP1Q15025 636 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 RASSF7Q02833 373 aa24.72■■□□□ 1.55
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CTU2-202ENST00000453996 MTMR14Q8NCE2 650 aa24.72■■□□□ 1.55
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CTU2-202ENST00000453996 KIF28PB7ZC32 967 aa24.72■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 GNAQP50148 359 aa24.72■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 MTMR4Q9NYA4 1195 aa24.72■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 XBP1P17861 261 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 DEKP35659 375 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 CCDC17Q96LX7 622 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 DNAJC18Q9H819 358 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 V9GY48 417 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 MMP1P03956 469 aa24.7■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 PKN1Q16512 942 aa24.7■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 USP28Q96RU2 1077 aa24.7■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 MAD2L2Q9UI95 211 aa24.7■■□□□ 1.55
CTU2-202ENST00000453996 SPDYE2Q495Y8 402 aa24.7■■□□□ 1.54
CTU2-202ENST00000453996 MYSM1Q5VVJ2 828 aa24.7■■□□□ 1.54
CTU2-202ENST00000453996 MYH4Q9Y623 1939 aa24.69■■□□□ 1.54
CTU2-202ENST00000453996 CLRN2A0PK11 232 aa24.69■■□□□ 1.54
CTU2-202ENST00000453996 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP24.69■■□□□ 1.54
CTU2-202ENST00000453996 MMP14P50281 582 aa24.69■■□□□ 1.54
CTU2-202ENST00000453996 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
CTU2-202ENST00000453996 TMEM63CQ9P1W3 806 aa24.69■■□□□ 1.54
CTU2-202ENST00000453996 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
CTU2-202ENST00000453996 RPS12P25398 132 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
CTU2-202ENST00000453996 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa24.68■■□□□ 1.54
CTU2-202ENST00000453996 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa24.68■■□□□ 1.54
CTU2-202ENST00000453996 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
CTU2-202ENST00000453996 STAG2Q8N3U4 1231 aa24.68■■□□□ 1.54
CTU2-202ENST00000453996 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP24.68■■□□□ 1.54
CTU2-202ENST00000453996 RCOR1Q9UKL0 485 aa24.68■■□□□ 1.54
CTU2-202ENST00000453996 KCNJ14Q9UNX9 436 aa24.68■■□□□ 1.54
CTU2-202ENST00000453996 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa24.67■■□□□ 1.54
CTU2-202ENST00000453996 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa24.67■■□□□ 1.54
CTU2-202ENST00000453996 TCP10L2B9ZVM9 353 aa24.67■■□□□ 1.54
CTU2-202ENST00000453996 TTLL1O95922 423 aa24.67■■□□□ 1.54
CTU2-202ENST00000453996 TPRNQ4KMQ1 711 aa24.67■■□□□ 1.54
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