RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 GIPRP48546 466 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 CDCP2Q5VXM1 449 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 OGFOD3Q6PK18 319 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 SHKBP1Q8TBC3 707 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
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RBM39-211ENST00000426951 CNNM2Q9H8M5 875 aa6.72□□□□□ -1.33
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RBM39-211ENST00000426951 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
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RBM39-211ENST00000426951 ATP2B1P20020 1258 aa6.7□□□□□ -1.34
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RBM39-211ENST00000426951 CYP27C1Q4G0S4 372 aa6.7□□□□□ -1.34
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RBM39-211ENST00000426951 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa6.7□□□□□ -1.34
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RBM39-211ENST00000426951 ZNF408Q9H9D4 720 aa6.7□□□□□ -1.34
RBM39-211ENST00000426951 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
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RBM39-211ENST00000426951 GUCY2CP25092 1073 aa6.69□□□□□ -1.34
RBM39-211ENST00000426951 ITGB7P26010 798 aa6.69□□□□□ -1.34
RBM39-211ENST00000426951 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
RBM39-211ENST00000426951 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RBM39-211ENST00000426951 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.69□□□□□ -1.34
RBM39-211ENST00000426951 CEP131Q9UPN4 1083 aa6.69□□□□□ -1.34
RBM39-211ENST00000426951 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa6.69□□□□□ -1.34
RBM39-211ENST00000426951 UBOX5O94941 541 aa6.68□□□□□ -1.34
RBM39-211ENST00000426951 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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RBM39-211ENST00000426951 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RBM39-211ENST00000426951 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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RBM39-211ENST00000426951 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa6.68□□□□□ -1.34
RBM39-211ENST00000426951 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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RBM39-211ENST00000426951 STK10O94804 968 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RBM39-211ENST00000426951 CHMP4BP1P59074 171 aa6.67□□□□□ -1.34
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RBM39-211ENST00000426951 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.66□□□□□ -1.34
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RBM39-211ENST00000426951 TMEM192Q8IY95 271 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-211ENST00000426951 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
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RBM39-211ENST00000426951 SLC6A18Q96N87 628 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-211ENST00000426951 TNKS2Q9H2K2 1166 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-211ENST00000426951 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.66□□□□□ -1.34
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RBM39-211ENST00000426951 CBX7O95931 251 aa6.65□□□□□ -1.34
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RBM39-211ENST00000426951 CYP7A1P22680 504 aa6.65□□□□□ -1.34
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RBM39-211ENST00000426951 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-211ENST00000426951 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RBM39-211ENST00000426951 DRC1Q96MC2 740 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-211ENST00000426951 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
RBM39-211ENST00000426951 PIM2Q9P1W9 311 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-211ENST00000426951 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa6.65□□□□□ -1.34
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RBM39-211ENST00000426951 GNAT3A8MTJ3 354 aa6.64□□□□□ -1.35
RBM39-211ENST00000426951 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RBM39-211ENST00000426951 CASP7P55210 303 aa6.64□□□□□ -1.35
RBM39-211ENST00000426951 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
RBM39-211ENST00000426951 TNNI3KQ59H18 835 aa6.64□□□□□ -1.35
RBM39-211ENST00000426951 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RBM39-211ENST00000426951 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.64□□□□□ -1.35
RBM39-211ENST00000426951 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RBM39-211ENST00000426951 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RBM39-211ENST00000426951 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.64□□□□□ -1.35
RBM39-211ENST00000426951 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6.64□□□□□ -1.35
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