RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424766.5

PMS1-211, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 3

Gene PMS1, Length 831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-211ENST00000424766 C19orf81C9J6K1 198 aa24.38■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 FAM47AQ5JRC9 791 aa24.38■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 RNF20Q5VTR2 975 aa24.38■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 KRT23Q9C075 422 aa24.38■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 PLIN4Q96Q06 1357 aa24.38■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa24.37■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 TRIM75PA6NK02 468 aa24.37■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 USP17L10C9JJH3 530 aa24.37■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 SLC27A2O14975 620 aa24.37■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 BACE1P56817 501 aa24.37■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 SH3D19Q5HYK7 790 aa24.37■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 CREB3L3Q68CJ9 461 aa24.37■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 SIAH1Q8IUQ4 282 aa24.37■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 JMYQ8N9B5 988 aa24.37■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 ESR2Q92731 530 aa24.37■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 ICA1Q05084 483 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 CCL15Q16663 113 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 NYAP2Q9P242 653 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 NEDD4P46934 1319 aa24.35■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 MYH4Q9Y623 1939 aa24.35■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 E7EWF7 191 aa24.35■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 TRDNQ13061 729 aa24.35■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 BRI3BPQ8WY22 251 aa24.35■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 USP26Q9BXU7 913 aa24.35■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa24.35■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 MTMR4Q9NYA4 1195 aa24.35■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 EEF2P13639 858 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 USP14P54578 494 aa24.34■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 TSGA10IPQ3SY00 556 aa24.34■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 USP17L2Q6R6M4 530 aa24.34■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 ACER1Q8TDN7 264 aa24.34■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 SH2D4AQ9H788 454 aa24.34■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 TMX2Q9Y320 296 aa24.34■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 B4E1Z4 1266 aa24.33■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 MTMR2Q13614 643 aa24.33■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 MOGSQ13724 837 aa24.33■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa24.33■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 IFNL1Q8IU54 200 aa24.33■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 NCOA7Q8NI08 942 aa24.33■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 KCNB2Q92953 911 aa24.33■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 MKL1Q969V6 931 aa24.33■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 CEP95Q96GE4 821 aa24.33■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 PTPN18Q99952 460 aa24.33■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 IL17RBQ9NRM6 502 aa24.33■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 ZSWIM5Q9P217 1185 aa24.33■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 TAF6LQ9Y6J9 622 aa24.33■■□□□ 1.49
PMS1-211ENST00000424766 A0A1W2PRG0 241 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 KDM4AO75164 1064 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 HSPA4P34932 840 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 HMGCS2P54868 508 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 C8orf34Q49A92 452 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 CCDC178Q5BJE1 867 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 CLEC10AQ8IUN9 316 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 FEZ1Q99689 392 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 TMOD4Q9NZQ9 345 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 LOC285556D6RIA3 1793 aa24.31■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 TTLL1O95922 423 aa24.31■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 ALDH1A1P00352 501 aa24.31■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 NOVP48745 357 aa24.31■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 GADL1Q6ZQY3 521 aa24.31■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 STOX1Q6ZVD7 989 aa24.31■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 ANKRD23Q86SG2 305 aa24.31■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 NKX2-3Q8TAU0 364 aa24.31■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 C12orf42Q96LP6 360 aa24.31■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 TTC14Q96N46 770 aa24.31■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 CLIP2Q9UDT6 1046 aa24.31■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa24.31■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 BTBD19C9JJ37 291 aa24.3■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 ATP2B2Q01814 1243 aa24.3■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 GPAT2Q6NUI2 795 aa24.3■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 IQCA1Q86XH1 822 aa24.3■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 EMILIN3Q9NT22 766 aa24.3■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 WBP1LQ9NX94 342 aa24.3■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 KRT32Q14532 448 aa24.29■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 RASEFQ8IZ41 740 aa24.29■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa24.29■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 NMT2O60551 498 aa24.28■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 MCCP23508 829 aa24.28■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 DGKHQ86XP1 1220 aa24.28■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.28■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 BEGAINQ9BUH8 593 aa24.28■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 VCPKMTQ9H867 229 aa24.28■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 GOPCQ9HD26 462 aa24.28■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa24.28■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP24.27■■□□□ 1.48
PMS1-211ENST00000424766 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms