RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418548.3

SFTA3-201, Transcript of surfactant associated 3, humanhuman

TSL 3

Gene SFTA3, Length 870 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3-201ENST00000418548 TMEM179Q6ZVK1 233 aa16.88■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 BRF1Q92994 677 aa16.88■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 CABP5Q9NP86 173 aa16.88■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 MTMR4Q9NYA4 1195 aa16.88■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa16.88■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 TNKSO95271 1327 aa16.88■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 KIF3CO14782 793 aa16.87■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 NF2P35240 595 aa16.87■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 WTAPQ15007 396 aa16.87■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 MAP3K11Q16584 847 aa16.87■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa16.87■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 CEP95Q96GE4 821 aa16.87■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 KANSL2Q9H9L4 492 aa16.87■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 SENP2Q9HC62 589 aa16.87■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 GDF11O95390 407 aa16.86■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 GH2P01242 217 aa16.86■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 ASNSP08243 561 aa16.86■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 MKL1Q969V6 931 aa16.86■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 TBC1D2Q9BYX2 928 aa16.86■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 NYAP2Q9P242 653 aa16.86■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa16.86■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 TPCN1Q9ULQ1 816 aa16.86■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 INPP5BP32019 993 aa16.85■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 APOBRQ0VD83 1088 aa16.85■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 SEPT2Q15019 361 aa16.85■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 SIAH1Q8IUQ4 282 aa16.85■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP16.85■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 BRPF3Q9ULD4 1205 aa16.85■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 ATAD5Q96QE3 1844 aa16.84■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 TRAF5O00463 557 aa16.84■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 TTLL1O95922 423 aa16.84■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 TOP1P11387 765 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 IREB2P48200 963 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 RCAN1P53805 252 aa16.84■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 MAP3K9P80192 1104 aa16.84■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 HSCBQ8IWL3 235 aa16.84■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 SCYL3Q8IZE3 742 aa16.84■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 WRNIP1Q96S55 665 aa16.84■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 TMEM47Q9BQJ4 181 aa16.84■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 FZD1Q9UP38 647 aa16.84■□□□□ 0.29
SFTA3-201ENST00000418548 CCDC69A6NI79 296 aa16.83■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 UNCXA6NJT0 531 aa16.83■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 BECN1Q14457 450 aa16.83■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 ME3Q16798 604 aa16.83■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 APOA5Q6Q788 366 aa16.83■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 TMX3Q96JJ7 454 aa16.83■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa16.83■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 STX8Q9UNK0 236 aa16.83■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 MYH4Q9Y623 1939 aa16.83■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 SLC12A7Q9Y666 1083 aa16.83■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 DOCK1Q14185 1865 aa16.82■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa16.82■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa16.82■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 PFKFB2O60825 505 aa16.82■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 EEF2P13639 858 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 FKBP1BP68106 108 aa16.82■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 ICA1Q05084 483 aa16.82■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP16.82■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 TROAPQ12815 778 aa16.82■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 RAB3GAP1Q15042 981 aa16.82■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 LDLRAD1Q5T700 205 aa16.82■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 NFXL1Q6ZNB6 911 aa16.82■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 ARMC9Q7Z3E5 817 aa16.82■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 ZNF654Q8IZM8 581 aa16.82■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 KAT14Q9H8E8 782 aa16.82■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 CLIP2Q9UDT6 1046 aa16.82■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 HPS5Q9UPZ3 1129 aa16.82■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 TRPM7Q96QT4 1865 aa16.82■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 LARGE1O95461 756 aa16.81■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 CUL4AQ13619 759 aa16.81■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 PRKG1Q13976 671 aa16.81■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa16.81■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 CATIPQ7Z7H3 387 aa16.81■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 CLEC10AQ8IUN9 316 aa16.81■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 PNMA1Q8ND90 353 aa16.81■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 MAP3K14Q99558 947 aa16.81■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 NID2Q14112 1375 aa16.8■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 USP17L5A8MUK1 530 aa16.8■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 ZBTB43O43298 467 aa16.8■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 DDAH1O94760 285 aa16.8■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 TOMM70O94826 608 aa16.8■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 CALM1P0DP23 149 aa16.8■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 CALM2P0DP24 149 aa16.8■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 CALM3P0DP25 149 aa16.8■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 PTPRAP18433 802 aa16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms