RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 SLC5A1P13866 664 aa7.21□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 PHKA1P46020 1223 aa7.21□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 NEK4P51957 841 aa7.21□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 CHRNDQ07001 517 aa7.21□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 UBE4AQ14139 1066 aa7.21□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 NFKBIBQ15653 356 aa7.21□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa7.21□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM132AQ24JP5 1023 aa7.21□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 WDR44Q5JSH3 913 aa7.21□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 CREB3L3Q68CJ9 461 aa7.21□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa7.21□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 BTBD6Q96KE9 485 aa7.21□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 NLRP3Q96P20 1036 aa7.21□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 MPHOSPH8Q99549 860 aa7.21□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 PHF24Q9UPV7 400 aa7.21□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa7.2□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 F11P03951 625 aa7.2□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 CHGBP05060 677 aa7.2□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 RXRBP28702 533 aa7.2□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 ZAP70P43403 619 aa7.2□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 RPS8P62241 208 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 RAB3GAP1Q15042 981 aa7.2□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 UBE3CQ15386 1083 aa7.2□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 QPCTQ16769 361 aa7.2□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 CRY2Q49AN0 593 aa7.2□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 GORABQ5T7V8 394 aa7.2□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 VPS53Q5VIR6 699 aa7.2□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 BICDL1Q6ZP65 573 aa7.2□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 CLEC17AQ6ZS10 378 aa7.2□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 OSBP2Q969R2 916 aa7.2□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 TMX3Q96JJ7 454 aa7.2□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.2□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 MINPP1Q9UNW1 487 aa7.2□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 MAST3O60307 1309 aa7.2□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 IRS2Q9Y4H2 1338 aa7.2□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 A0A1B0GUL6 1792 aa7.19□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa7.19□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 FOXP2O15409 715 aa7.19□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 LILRB3O75022 631 aa7.19□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 ADD2P35612 726 aa7.19□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 AMHR2Q16671 573 aa7.19□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.19□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 ADCK5Q3MIX3 580 aa7.19□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 RNF20Q5VTR2 975 aa7.19□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 PRR5LQ6MZQ0 368 aa7.19□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa7.19□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 PI16Q6UXB8 463 aa7.19□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa7.19□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 FBXO33Q7Z6M2 555 aa7.19□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 SPATA5Q8NB90 893 aa7.19□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 APPBP2Q92624 585 aa7.19□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 FKBPLQ9UIM3 349 aa7.19□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 GGA1Q9UJY5 639 aa7.19□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 CASZ1Q86V15 1759 aa7.18□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 M0R2C6 588 aa7.18□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 SNAP23O00161 211 aa7.18□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 IGSF3O75054 1194 aa7.18□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 EPXP11678 715 aa7.18□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 PSMA5P28066 241 aa7.18□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 RAB15P59190 212 aa7.18□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 DDR1Q08345 913 aa7.18□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 RASGRF1Q13972 1273 aa7.18□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 LRP8Q14114 963 aa7.18□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 KRT32Q14532 448 aa7.18□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 SLFNL1Q499Z3 407 aa7.18□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 POTEAQ6S8J7 498 aa7.18□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 RUFY3Q7L099 469 aa7.18□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 CNBD1Q8NA66 436 aa7.18□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP7.18□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 ANKRD2Q9GZV1 360 aa7.18□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.18□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa7.18□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 TAF6LQ9Y6J9 622 aa7.18□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
C6orf48-208ENST00000395788 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.5 ms