RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 USP17L24Q0WX57 530 aa10.17□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 TREML2Q5T2D2 321 aa10.17□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 LNPKQ9C0E8 428 aa10.17□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 KANSL2Q9H9L4 492 aa10.17□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 SRRDQ9UH36 339 aa10.17□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa10.17□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 IGHDP01880 384 aa10.16□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 SLFNL1Q499Z3 407 aa10.16□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa10.16□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa10.16□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 COA7Q96BR5 231 aa10.16□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 ARMC5Q96C12 935 aa10.16□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 MKNK2Q9HBH9 465 aa10.16□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa10.16□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 EMILIN3Q9NT22 766 aa10.16□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 MORF4L1Q9UBU8 362 aa10.16□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 LOC285556D6RIA3 1793 aa10.16□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 HIP1O00291 1037 aa10.15□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 CYP2D6P10635 497 aa10.15□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 CAPN2P17655 700 aa10.15□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 TDO2P48775 406 aa10.15□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 PDE4BQ07343 736 aa10.15□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 SEPT2Q15019 361 aa10.15□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa10.15□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa10.15□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 IFNL3Q8IZI9 196 aa10.15□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 LPAR1Q92633 364 aa10.15□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 DYNLL2Q96FJ2 89 aa10.15□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 TRIM47Q96LD4 638 aa10.15□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 NAPBQ9H115 298 aa10.15□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 HOXC10Q9NYD6 342 aa10.15□□□□□ -0.78
MT-TS1-201ENST00000387416 MYH8P13535 1937 aa10.15□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 MINDY4BA8MYZ0 360 aa10.14□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa10.14□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 M0R2C6 588 aa10.14□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 CHGBP05060 677 aa10.14□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 GUCY1A2P33402 732 aa10.14□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 HERVK_113P62684 666 aa10.14□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 CCNA1P78396 465 aa10.14□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 ICA1Q05084 483 aa10.14□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 ALX1Q15699 326 aa10.14□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa10.14□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 LBX2Q6XYB7 198 aa10.14□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa10.14□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa10.14□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa10.14□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 RAET1EQ8TD07 263 aa10.14□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM106CQ9BVX2 250 aa10.14□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa10.14□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 TMX2Q9Y320 296 aa10.14□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa10.14□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa10.14□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 ROBO3Q96MS0 1386 aa10.14□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 MYPNQ86TC9 1320 aa10.13□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa10.13□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 AKR1B1P15121 316 aa10.13□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 VCAM1P19320 739 aa10.13□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 MAPK4P31152 587 aa10.13□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 IRF5Q13568 498 aa10.13□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 COG2Q14746 738 aa10.13□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 MB21D1Q8N884 522 aa10.13□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC44A5Q8NCS7 719 aa10.13□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 ACER1Q8TDN7 264 aa10.13□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 PXYLP1Q8TE99 480 aa10.13□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa10.13□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 GOPCQ9HD26 462 aa10.13□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 NYAP2Q9P242 653 aa10.13□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 DOCK3Q8IZD9 2030 aa10.12□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 WDR46O15213 610 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 RASA1P20936 1047 aa10.12□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 GRK4P32298 578 aa10.12□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 NT5C2P49902 561 aa10.12□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 UBXN2AP68543 259 aa10.12□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 CAP1Q01518 475 aa10.12□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 SLAIN1Q8ND83 568 aa10.12□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 RILPL2Q969X0 211 aa10.12□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF333Q96JL9 665 aa10.12□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 VCPKMTQ9H867 229 aa10.12□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 RBPJLQ9UBG7 517 aa10.12□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 MGAMO43451 1857 aa10.12□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 ZMYM6O95789 1325 aa10.11□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A1W2PRG0 241 aa10.11□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 PCP11498 1178 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 EEF2P13639 858 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 SDSP20132 328 aa10.11□□□□□ -0.79
MT-TS1-201ENST00000387416 CTGFP29279 349 aa10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms