RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380283.4

PXDC1-202, Transcript of PX domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PXDC1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1-202ENST00000380283 SLC5A1P13866 664 aa30.12■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 ADD2P35612 726 aa30.12■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 IARSP41252 1262 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 SARSP49591 514 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 TRIM29Q14134 588 aa30.12■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 PTPN21Q16825 1174 aa30.12■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa30.12■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 NKX2-3Q8TAU0 364 aa30.12■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 DACH1Q9UI36 760 aa30.12■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 TXLNBQ8N3L3 684 aa30.11■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa30.11■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 ARFGAP3Q9NP61 516 aa30.11■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 CHD4Q14839 1912 aa30.11■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 ZBTB43O43298 467 aa30.1■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 GRAPQ13588 217 aa30.1■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 POSTNQ15063 836 aa30.1■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa30.1■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 TRIML1Q8N9V2 468 aa30.1■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa30.1■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 FOXN1O15353 648 aa30.1■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 RXRAP19793 462 aa30.09■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP30.09■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 MORC3Q14149 939 aa30.09■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 PI16Q6UXB8 463 aa30.09■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 STK11IPQ8N1F8 1099 aa30.09■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 PARD6BQ9BYG5 372 aa30.09■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 EPC1Q9H2F5 836 aa30.09■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 OAS2P29728 719 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 SLC20A2Q08357 652 aa30.08■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 MUM1L1Q5H9M0 696 aa30.08■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 MICU3Q86XE3 530 aa30.08■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 PDILTQ8N807 584 aa30.08■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 GOLGA1Q92805 767 aa30.08■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 BRIP1Q9BX63 1249 aa30.08■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 FUT8Q9BYC5 575 aa30.08■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 SENP2Q9HC62 589 aa30.08■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 NOSTRINQ8IVI9 506 aa30.08■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 LY9Q9HBG7 655 aa30.08■■■□□ 2.41
PXDC1-202ENST00000380283 PTPREP23469 700 aa30.07■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 MCAMP43121 646 aa30.07■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 PHKA1P46020 1223 aa30.07■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 ADKP55263 362 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 NR1I3Q14994 352 aa30.07■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 NID2Q14112 1375 aa30.07■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 NRXN2Q9P2S2 1712 aa30.06■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 GOLGA8AA7E2F4 631 aa30.06■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 LIFRP42702 1097 aa30.06■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 UBE4AQ14139 1066 aa30.06■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 UBE3CQ15386 1083 aa30.06■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 DHX58Q96C10 678 aa30.06■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 RAI14Q9P0K7 980 aa30.06■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 CCDC151A5D8V7 595 aa30.05■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 B4E1Z4 1266 aa30.05■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 ZBTB22O15209 634 aa30.05■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 TXLNAP40222 546 aa30.05■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 PANX2Q96RD6 677 aa30.05■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 QSER1Q2KHR3 1735 aa30.05■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 GPS2Q13227 327 aa30.05■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 A0A1B0GTH6 734 aa30.04■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 BRD3Q15059 726 aa30.04■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 SPATA20Q8TB22 786 aa30.04■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 WASF1Q92558 559 aa30.04■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 SMARCE1Q969G3 411 aa30.04■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 ANKRD2Q9GZV1 360 aa30.04■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa30.04■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 MED15Q96RN5 788 aa30.04■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 MMP1P03956 469 aa30.03■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 ALX1Q15699 326 aa30.03■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 ARAP2Q8WZ64 1704 aa30.03■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 CCDC175P0C221 793 aa30.03■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa30.03■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 PRR29P0C7W0 189 aa30.03■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 IFNAR1P17181 557 aa30.03■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 BCAMP50895 628 aa30.03■■■□□ 2.4
PXDC1-202ENST00000380283 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.6 ms