RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377962.7

CNMD-201, Transcript of chondromodulin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNMD, Length 1,410 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNMD-201ENST00000377962 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 TREML2Q5T2D2 321 aa14.93□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 ACER1Q8TDN7 264 aa14.93□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 ROBO3Q96MS0 1386 aa14.93□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 PDHXO00330 501 aa14.92□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 ALX1Q15699 326 aa14.92□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 WDR18Q9BV38 432 aa14.92□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 AS3MTQ9HBK9 375 aa14.92□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 CABP5Q9NP86 173 aa14.92□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 LOC285556D6RIA3 1793 aa14.92□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 HAND2P61296 217 aa14.92□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa14.92□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 ANKRD23Q86SG2 305 aa14.92□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 SIAH1Q8IUQ4 282 aa14.92□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 MKNK2Q9HBH9 465 aa14.92□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 RAD50Q92878 1312 aa14.91□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 A0A1W2PRG0 241 aa14.91□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 ALDH1A1P00352 501 aa14.91□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 CYP2C8P10632 490 aa14.91□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 BACE1P56817 501 aa14.91□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 FAM47AQ5JRC9 791 aa14.91□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 NKX2-3Q8TAU0 364 aa14.91□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 NBPF3Q9H094 633 aa14.91□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 EMILIN3Q9NT22 766 aa14.91□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 GINM1Q9NU53 330 aa14.91□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 USP17L10C9JJH3 530 aa14.9□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 GPR25O00155 361 aa14.9□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 PTH1RQ03431 593 aa14.9□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 C8orf34Q49A92 452 aa14.9□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 SH3D19Q5HYK7 790 aa14.9□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa14.9□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 TMEM179Q6ZVK1 233 aa14.9□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 CCDC17Q96LX7 622 aa14.9□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 FEZ1Q99689 392 aa14.9□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 TBC1D2Q9BYX2 928 aa14.9□□□□□ -0.02
CNMD-201ENST00000377962 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa14.89□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 CAP1Q01518 475 aa14.89□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa14.89□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 TBC1D10CQ8IV04 446 aa14.89□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 CFHR5Q9BXR6 569 aa14.89□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 PRDM10Q9NQV6 1147 aa14.89□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa14.89□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 LAMA4Q16363 1823 aa14.88□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 EEF2P13639 858 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 ATP2B2Q01814 1243 aa14.88□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 ICA1Q05084 483 aa14.88□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 PDE4BQ07343 736 aa14.88□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 DSCC1Q9BVC3 393 aa14.88□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa14.88□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 CPA4Q9UI42 421 aa14.88□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 ANAPC4Q9UJX5 808 aa14.88□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.88□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 C19orf81C9J6K1 198 aa14.87□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 TFAP4Q01664 338 aa14.87□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 USP17L2Q6R6M4 530 aa14.87□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa14.87□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 ANO2Q9NQ90 1003 aa14.87□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 TOMM22Q9NS69 142 aa14.87□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 TMOD4Q9NZQ9 345 aa14.87□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 ZMYM6O95789 1325 aa14.87□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 MYH4Q9Y623 1939 aa14.87□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 NMT2O60551 498 aa14.86□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 TLR2O60603 784 aa14.86□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 PEX10O60683 326 aa14.86□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 SEC24BO95487 1268 aa14.86□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 SPICE1Q8N0Z3 855 aa14.86□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 MAP4K1Q92918 833 aa14.86□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.86□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 ADGRA2Q96PE1 1338 aa14.86□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa14.85□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 ZNF213O14771 459 aa14.85□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 FKTNO75072 461 aa14.85□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 REC8O95072 547 aa14.85□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 FGRP09769 529 aa14.85□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 CEP95Q96GE4 821 aa14.85□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 ZNF287Q9HBT7 754 aa14.85□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 IL17RBQ9NRM6 502 aa14.85□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 NEDD4P46934 1319 aa14.85□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 RAD21O60216 631 aa14.84□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 TSPY3P0CV98 308 aa14.84□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 TSPY8P0CW00 308 aa14.84□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 VCAM1P19320 739 aa14.84□□□□□ -0.03
CNMD-201ENST00000377962 AKNAD1Q5T1N1 836 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms