RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 DOT1LQ8TEK3 1739 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 KCNA4P22459 653 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 GRK4P32298 578 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 RGS2P41220 211 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 KCNJ6P48051 423 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 IGBP1P78318 339 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 GNASQ5JWF2 1037 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 MMP19Q99542 508 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 CNNM2Q9H8M5 875 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 PRM3Q9NNZ6 103 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
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PTPRC-201ENST00000348564 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa5.14□□□□□ -1.59
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PTPRC-201ENST00000348564 CIAO1O76071 339 aa5.14□□□□□ -1.59
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PTPRC-201ENST00000348564 ALG1Q9BT22 464 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
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PTPRC-201ENST00000348564 LRFN2Q9ULH4 789 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 MYPNQ86TC9 1320 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 C19orf81C9J6K1 198 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRC-201ENST00000348564 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 BMP3P12645 472 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 CTDSPL2Q05D32 466 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRC-201ENST00000348564 SCYL3Q8IZE3 742 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 SWAP70Q9UH65 585 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 CACNA1FO60840 1977 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRC-201ENST00000348564 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 ENTPD3O75355 529 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRC-201ENST00000348564 PLCB2Q00722 1185 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 PDE4CQ08493 712 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM179Q6ZVK1 233 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRC-201ENST00000348564 IRF6O14896 467 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRC-201ENST00000348564 CDKL5O76039 1030 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 NEK4P51957 841 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 SH3TC2Q8TF17 1288 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 UBA5Q9GZZ9 404 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 ITGB4P16144 1822 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 FZD9O00144 591 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 MMP14P50281 582 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 CCT2P78371 535 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 NFIAQ12857 509 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 VGLL4Q14135 290 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 POLA2Q14181 598 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 KCTD1Q719H9 257 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRC-201ENST00000348564 METTL13Q8N6R0 699 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRC-201ENST00000348564 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 SHANK3Q9BYB0 1731 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 UTYO14607 1347 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 CXCL11O14625 94 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 SLC16A2P36021 539 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 FLT3LGP49771 235 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 FAM83BQ5T0W9 1011 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 SPRYD7Q5W111 196 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 NLRX1Q86UT6 975 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 TMTC2Q8N394 836 aa5.12□□□□□ -1.59
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