RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 TMTC1Q8IUR5 882 aa23.18■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 FAM212AQ96EL1 285 aa23.18■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 NUP58Q9BVL2 599 aa23.18■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 OPA1O60313 960 aa23.18■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 TUBBP07437 444 aa23.18■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.18■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 GJC1P36383 396 aa23.18■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 NCAPD2Q15021 1401 aa23.18■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 DDAH1O94760 285 aa23.17■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 APBA3O96018 575 aa23.17■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 SUPT20HQ8NEM7 779 aa23.17■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.17■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 IGKV5-2P06315 115 aa23.17■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.17■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 H7C1W4 665 aa23.17■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 BTDP43251 543 aa23.17■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 NECTIN1Q15223 517 aa23.17■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 VWA3BQ502W6 1294 aa23.17■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa23.17■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 ZBTB9Q96C00 473 aa23.17■■□□□ 1.3
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NISCH-201ENST00000345716 TBC1D7Q9P0N9 293 aa23.17■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 DNM3Q9UQ16 869 aa23.17■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 CARMIL3Q8ND23 1372 aa23.17■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 KRBA2Q6ZNG9 492 aa23.16■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 PLCD4Q9BRC7 762 aa23.16■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 LARGE1O95461 756 aa23.16■■□□□ 1.3
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NISCH-201ENST00000345716 CALUO43852 315 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 FMNL3Q8IVF7 1028 aa23.16■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.16■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 ARHGEF35A5YM69 484 aa23.16■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 ERVV-1B6SEH8 477 aa23.16■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 KLRF2D3W0D1 207 aa23.16■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 VAV2P52735 878 aa23.16■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa23.16■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 PCP11498 1178 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 ERCC3P19447 782 aa23.16■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 INF2Q27J81 1249 aa23.16■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 IFT81Q8WYA0 676 aa23.16■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 JAKMIP2Q96AA8 810 aa23.16■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 CARD6Q9BX69 1037 aa23.16■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 CFBP00751 764 aa23.15■■□□□ 1.3
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NISCH-201ENST00000345716 EPHA10Q5JZY3 1008 aa23.15■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP23.15■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP23.15■■□□□ 1.36e-6■□□□□ 10.8
NISCH-201ENST00000345716 MYRIPQ8NFW9 859 aa23.15■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 PICK1Q9NRD5 415 aa23.15■■□□□ 1.3
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NISCH-201ENST00000345716 STK24Q9Y6E0 443 aa23.15■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 MED14O60244 1454 aa23.15■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 PDE6BP35913 854 aa23.15■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 CLEC11AQ9Y240 323 aa23.15■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 A0A1W2PQ27 194 aa23.15■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 A0A1W2PQ64 194 aa23.15■■□□□ 1.3
NISCH-201ENST00000345716 A0A1W2PQD8 194 aa23.15■■□□□ 1.3
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NISCH-201ENST00000345716 ZNF827Q17R98 1081 aa23.14■■□□□ 1.3
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NISCH-201ENST00000345716 NELFCDQ8IXH7 590 aa23.14■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 CPXCR1Q8N123 301 aa23.14■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.14■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 CCDC169A6NNP5 214 aa23.14■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 ERFEQ4G0M1 354 aa23.14■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 ATP10DQ9P241 1426 aa23.13■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 DLGAP5Q15398 846 aa23.13■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 BRINP3Q76B58 766 aa23.13■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 PPIP5K2O43314 1243 aa23.13■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 SMTNP53814 917 aa23.13■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 LONRF3Q496Y0 759 aa23.13■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.13■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 SLC39A14Q15043 492 aa23.13■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 SCNN1DP51172 638 aa23.12■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 ASIC2Q16515 512 aa23.12■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 DDX12PQ92771 950 aa23.12■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 PRKAB2O43741 272 aa23.12■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 ADKP55263 362 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 CEP152O94986 1710 aa23.12■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 TUBB2AQ13885 445 aa23.12■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 DOK7Q18PE1 504 aa23.12■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 CCDC50Q8IVM0 306 aa23.12■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 FERMT1Q9BQL6 677 aa23.12■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 TUBB2BQ9BVA1 445 aa23.12■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.12■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 SLF1Q9BQI6 1058 aa23.12■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa23.11■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 IKBKGQ9Y6K9 419 aa23.11■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.11■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 KCNQ4P56696 695 aa23.11■■□□□ 1.29
NISCH-201ENST00000345716 LRMPQ12912 555 aa23.11■■□□□ 1.29
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