RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 TSPY8P0CW00 308 aa7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 GABPAQ06546 454 aa7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 SPDYE2Q495Y8 402 aa7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 CREBRFQ8IUR6 639 aa7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 MYOZ2Q9NPC6 264 aa7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 ZDHHC9Q9Y397 364 aa7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 GJA3Q9Y6H8 435 aa7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 SHTN1A0MZ66 631 aa7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 GOLGA8AA7E2F4 631 aa7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 CCDC178Q5BJE1 867 aa7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 MYL10Q9BUA6 226 aa7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 EHD4Q9H223 541 aa7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 TMOD2Q9NZR1 351 aa7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 SWAP70Q9UH65 585 aa7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 PTPDC1A2A3K4 754 aa7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 RXRAP19793 462 aa7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 SYT1P21579 422 aa7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 RCAN1P53805 252 aa7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 MICU3Q86XE3 530 aa7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 EXOC8Q8IYI6 725 aa7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 ZNF654Q8IZM8 581 aa7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 IL17RBQ9NRM6 502 aa7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 SERPINB13Q9UIV8 391 aa7.04□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 ATRNL1Q5VV63 1379 aa7.03□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 CLRN2A0PK11 232 aa7.03□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 TCP10L2B9ZVM9 353 aa7.03□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 STX6O43752 255 aa7.03□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 CDC27P30260 824 aa7.03□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa7.03□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 DPF2Q92785 391 aa7.03□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 IRF6O14896 467 aa7.03□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 PRR29P0C7W0 189 aa7.03□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 NFKBIBQ15653 356 aa7.03□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 DDX11Q96FC9 970 aa7.03□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 MRVI1Q9Y6F6 885 aa7.03□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 CNTNAP1P78357 1384 aa7.03□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 PLIN4Q96Q06 1357 aa7.03□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 WNT10BO00744 389 aa7.03□□□□□ -1.28
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CCR6-201ENST00000341935 MYO1BO43795 1136 aa7.03□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 SHMT1P34896 483 aa7.03□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
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CCR6-201ENST00000341935 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 PI4KBQ9UBF8 816 aa7.03□□□□□ -1.28
CCR6-201ENST00000341935 DDAH1O94760 285 aa7.02□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 PDCP20941 246 aa7.02□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 NBPF9Q3BBW0 867 aa7.02□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 TMCO4Q5TGY1 634 aa7.02□□□□□ -1.29
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CCR6-201ENST00000341935 DGKHQ86XP1 1220 aa7.02□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
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CCR6-201ENST00000341935 CALM3P0DP25 149 aa7.02□□□□□ -1.29
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CCR6-201ENST00000341935 ADD1P35611 737 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 PSEN1P49768 467 aa7.02□□□□□ -1.29
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CCR6-201ENST00000341935 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
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CCR6-201ENST00000341935 AKR1B1P15121 316 aa7.02□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 CLEC17AQ6ZS10 378 aa7.02□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 TRIM34Q9BYJ4 488 aa7.02□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 RNF181Q9P0P0 153 aa7.02□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 MTMR6Q9Y217 621 aa7.02□□□□□ -1.29
CCR6-201ENST00000341935 KIF3AQ9Y496 699 aa7.02□□□□□ -1.29
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