RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 NEMFO60524 1076 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 KLHL41O60662 606 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 KATNA1O75449 491 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 IL33O95760 270 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 BAG2O95816 211 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 HSPA1LP34931 641 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 PDE6CP51160 858 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 PTGDRQ13258 359 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 ELF2Q15723 593 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 TNNI3KQ59H18 835 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 SPDYCQ5MJ68 293 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 C1orf228Q6PIY5 440 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 LSMEM1Q8N8F7 131 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 KIAA1524Q8TCG1 905 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 USP33Q8TEY7 942 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 DDX12PQ92771 950 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 SARGQ9BW04 601 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 CAPS2Q9BXY5 557 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 CCDC113Q9H0I3 377 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 TRIM17Q9Y577 477 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 ZBTB39O15060 712 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 GFPT2O94808 682 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 SASH1O94885 1247 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 PGRP06401 933 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 GZMAP12544 262 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 MAPK8P45983 427 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 GTF2A2P52657 109 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 KIF11P52732 1056 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 MTMR3Q13615 1198 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 RAB33AQ14088 237 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 NBPF8Q3BBV2 869 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 WWC2Q6AWC2 1192 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 MCTP2Q6DN12 878 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 NLRP14Q86W24 1093 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 CARNMT1Q8N4J0 409 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 YIPF2Q9BWQ6 316 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 STRN4Q9NRL3 753 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 PRXQ9BXM0 1461 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 RNF123Q5XPI4 1314 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 RAD50Q92878 1312 aa7.91□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 TBKBP1A7MCY6 615 aa7.9□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 VSTM5A8MXK1 200 aa7.9□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 TREHO43280 583 aa7.9□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 TIPRLO75663 272 aa7.9□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 GUCY2FP51841 1108 aa7.9□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 NLRP6P59044 892 aa7.9□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 RAC1P63000 192 aa7.9□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 CCDC173Q0VFZ6 552 aa7.9□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 ARHGEF6Q15052 776 aa7.9□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 DIXDC1Q155Q3 683 aa7.9□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.9□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 NUGGCQ68CJ6 796 aa7.9□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 PEX5LQ8IYB4 626 aa7.9□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 CEP57L1Q8IYX8 460 aa7.9□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 SLAIN1Q8ND83 568 aa7.9□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 BICD1Q96G01 975 aa7.9□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 CFAP36Q96G28 342 aa7.9□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 CLMNQ96JQ2 1002 aa7.9□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 PRIMPOLQ96LW4 560 aa7.9□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 SLC13A1Q9BZW2 595 aa7.9□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 LRRCC1Q9C099 1032 aa7.9□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 NLRC4Q9NPP4 1024 aa7.9□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 DISC1Q9NRI5 854 aa7.9□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 ANKEF1Q9NU02 776 aa7.9□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 OBP2AQ9NY56 170 aa7.9□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 MCM8Q9UJA3 840 aa7.9□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 LEMD3Q9Y2U8 911 aa7.9□□□□□ -1.14
RRN3-202ENST00000327307 CFAP43Q8NDM7 1665 aa7.9□□□□□ -1.15
RRN3-202ENST00000327307 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa7.9□□□□□ -1.15
RRN3-202ENST00000327307 TTLL13PA6NNM8 815 aa7.9□□□□□ -1.15
RRN3-202ENST00000327307 PIK3CDO00329 1044 aa7.9□□□□□ -1.15
RRN3-202ENST00000327307 KPNA6O60684 536 aa7.9□□□□□ -1.15
RRN3-202ENST00000327307 MBD4O95243 580 aa7.9□□□□□ -1.15
RRN3-202ENST00000327307 SMC2O95347 1197 aa7.9□□□□□ -1.15
RRN3-202ENST00000327307 GNAT2P19087 354 aa7.9□□□□□ -1.15
RRN3-202ENST00000327307 CD9P21926 228 aa7.9□□□□□ -1.15
RRN3-202ENST00000327307 HOXD12P35452 270 aa7.9□□□□□ -1.15
RRN3-202ENST00000327307 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.15
RRN3-202ENST00000327307 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.15
RRN3-202ENST00000327307 SYCP1Q15431 976 aa7.9□□□□□ -1.15
RRN3-202ENST00000327307 CNGA3Q16281 694 aa7.9□□□□□ -1.15
RRN3-202ENST00000327307 FAM117BQ6P1L5 589 aa7.9□□□□□ -1.15
RRN3-202ENST00000327307 TMCO3Q6UWJ1 677 aa7.9□□□□□ -1.15
RRN3-202ENST00000327307 TMEM151BQ8IW70 566 aa7.9□□□□□ -1.15
RRN3-202ENST00000327307 RTKN2Q8IZC4 609 aa7.9□□□□□ -1.15
RRN3-202ENST00000327307 VPS52Q8N1B4 723 aa7.9□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms