RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa28.73■■■□□ 2.19
SENP3-201ENST00000321337 MFSD6Q6ZSS7 791 aa28.73■■■□□ 2.19
SENP3-201ENST00000321337 EXOC4Q96A65 974 aa28.73■■■□□ 2.19
SENP3-201ENST00000321337 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa28.73■■■□□ 2.19
SENP3-201ENST00000321337 WTAPQ15007 396 aa28.73■■■□□ 2.19
SENP3-201ENST00000321337 ALX1Q15699 326 aa28.73■■■□□ 2.19
SENP3-201ENST00000321337 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
SENP3-201ENST00000321337 VPS54Q9P1Q0 977 aa28.73■■■□□ 2.19
SENP3-201ENST00000321337 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa28.73■■■□□ 2.19
SENP3-201ENST00000321337 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa28.73■■■□□ 2.19
SENP3-201ENST00000321337 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
SENP3-201ENST00000321337 RAB21Q9UL25 225 aa28.73■■■□□ 2.19
SENP3-201ENST00000321337 DEXIO95424 95 aa28.72■■■□□ 2.19
SENP3-201ENST00000321337 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
SENP3-201ENST00000321337 LCORLQ8N3X6 602 aa28.72■■■□□ 2.19
SENP3-201ENST00000321337 MSANTD4Q8NCY6 345 aa28.72■■■□□ 2.19
SENP3-201ENST00000321337 L1RE1Q9UN81 338 aa28.72■■■□□ 2.19
SENP3-201ENST00000321337 CTSWP56202 376 aa28.72■■■□□ 2.19
SENP3-201ENST00000321337 KIF6Q6ZMV9 814 aa28.72■■■□□ 2.19
SENP3-201ENST00000321337 FOXR1Q6PIV2 292 aa28.71■■■□□ 2.19
SENP3-201ENST00000321337 NLRP10Q86W26 655 aa28.71■■■□□ 2.19
SENP3-201ENST00000321337 CEP112Q8N8E3 955 aa28.71■■■□□ 2.19
SENP3-201ENST00000321337 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
SENP3-201ENST00000321337 FAN1Q9Y2M0 1017 aa28.71■■■□□ 2.19
SENP3-201ENST00000321337 RASGRF1Q13972 1273 aa28.71■■■□□ 2.19
SENP3-201ENST00000321337 AK7Q96M32 723 aa28.71■■■□□ 2.19
SENP3-201ENST00000321337 CTNND2Q9UQB3 1225 aa28.71■■■□□ 2.19
SENP3-201ENST00000321337 KANK3Q6NY19 840 aa28.7■■■□□ 2.19
SENP3-201ENST00000321337 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa28.7■■■□□ 2.19
SENP3-201ENST00000321337 FANCBQ8NB91 859 aa28.7■■■□□ 2.19
SENP3-201ENST00000321337 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
SENP3-201ENST00000321337 BLZF1Q9H2G9 400 aa28.7■■■□□ 2.19
SENP3-201ENST00000321337 CTAGE9A4FU28 777 aa28.7■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 USP5P45974 858 aa28.7■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 MIGA1Q8NAN2 632 aa28.7■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 SPATA5Q8NB90 893 aa28.7■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 ASAP1Q9ULH1 1129 aa28.7■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 PHACTR2O75167 634 aa28.69■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 ARHGAP25P42331 645 aa28.69■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 HDXQ7Z353 690 aa28.69■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 ZNF654Q8IZM8 581 aa28.69■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 TDO2P48775 406 aa28.69■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 C10orf67Q8IYJ2 551 aa28.69■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 TRIM10Q9UDY6 481 aa28.69■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 NCAPH2Q6IBW4 605 aa28.68■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 KRT23Q9C075 422 aa28.68■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 VPS16Q9H269 839 aa28.68■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP28.68■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 SLC20A2Q08357 652 aa28.68■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 GOLGA5Q8TBA6 731 aa28.68■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 PSD3Q9NYI0 1048 aa28.68■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa28.68■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 MYO1CO00159 1063 aa28.67■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 TNS3Q68CZ2 1445 aa28.67■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 NID2Q14112 1375 aa28.67■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 TRIM75PA6NK02 468 aa28.67■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 KRT31Q15323 416 aa28.67■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 ZNF174Q15697 407 aa28.67■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 SLF1Q9BQI6 1058 aa28.67■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 CNNM2Q9H8M5 875 aa28.67■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 TFR2Q9UP52 801 aa28.67■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 TNS2Q63HR2 1409 aa28.67■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 ACTN2P35609 894 aa28.66■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 CEP131Q9UPN4 1083 aa28.66■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 ATF3P18847 181 aa28.66■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 PKN1Q16512 942 aa28.66■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 STAG1Q8WVM7 1258 aa28.66■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 TAB2Q9NYJ8 693 aa28.66■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 MYH8P13535 1937 aa28.65■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 CASP8Q14790 479 aa28.65■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 ABHD10Q9NUJ1 306 aa28.65■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 CHP1Q99653 195 aa28.64■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
SENP3-201ENST00000321337 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa28.64■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 CNGA4Q8IV77 575 aa28.64■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa28.64■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 XDHP47989 1333 aa28.64■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 CDHR2Q9BYE9 1310 aa28.64■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 CHD4Q14839 1912 aa28.64■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 N4BP3O15049 544 aa28.63■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 FGFR2P21802 821 aa28.63■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 MAP3K12Q12852 859 aa28.63■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 FILIP1LQ4L180 1135 aa28.63■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 CTAGE15A4D2H0 777 aa28.63■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 CTAGE8P0CG41 777 aa28.63■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 SART3Q15020 963 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 CTAGE6Q86UF2 777 aa28.63■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 CTAGE4Q8IX94 777 aa28.63■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 MTRQ99707 1265 aa28.63■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa28.63■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 PAPPAQ13219 1627 aa28.62■■■□□ 2.17
SENP3-201ENST00000321337 ERICH2A1L162 156 aa28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms