RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307227.9

SUCLG2-201, Transcript of succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUCLG2, Length 2,352 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2-201ENST00000307227 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 PLA2G4AP47712 749 aa14.55□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 ADKP55263 362 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 AKNAD1Q5T1N1 836 aa14.55□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 NT5DC1Q5TFE4 455 aa14.55□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa14.55□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 TMCO3Q6UWJ1 677 aa14.55□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa14.55□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 MAGEB6Q8N7X4 407 aa14.55□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 MLKLQ8NB16 471 aa14.55□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 FLAD1Q8NFF5 587 aa14.55□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 ARMT1Q9H993 441 aa14.55□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 STX10O60499 249 aa14.55□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 MORC3Q14149 939 aa14.55□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 TPTE2Q6XPS3 522 aa14.55□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa14.55□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 CCDC82Q8N4S0 544 aa14.55□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 SMARCE1Q969G3 411 aa14.55□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 WDR24Q96S15 920 aa14.55□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 MPHOSPH8Q99549 860 aa14.55□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa14.55□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 CNNM2Q9H8M5 875 aa14.55□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa14.55□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 COL24A1Q17RW2 1714 aa14.55□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 CASQ1P31415 396 aa14.54□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 GNG11P61952 73 aa14.54□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 RTN1Q16799 776 aa14.54□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 RILPL1Q5EBL4 403 aa14.54□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 MSL1Q68DK7 614 aa14.54□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 MFSD6Q6ZSS7 791 aa14.54□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.54□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 SPATA5Q8NB90 893 aa14.54□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 LPIN2Q92539 896 aa14.54□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 MED15Q96RN5 788 aa14.54□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 KRT23Q9C075 422 aa14.54□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 NYXQ9GZU5 481 aa14.54□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 DACH1Q9UI36 760 aa14.54□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 GSG1L2A8MUP6 293 aa14.54□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 FGFR2P21802 821 aa14.54□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 NR5A1Q13285 461 aa14.54□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 TAF3Q5VWG9 929 aa14.54□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 NID2Q14112 1375 aa14.54□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa14.53□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 PRKAB2O43741 272 aa14.53□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 TPM1P09493 284 aa14.53□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 MAP3K9P80192 1104 aa14.53□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 MAP3K12Q12852 859 aa14.53□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.53□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 EPC1Q9H2F5 836 aa14.53□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 TOMM22Q9NS69 142 aa14.53□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 ATP2B1P20020 1258 aa14.53□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 TM4SF1P30408 202 aa14.53□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 WTAPQ15007 396 aa14.53□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 USP49Q70CQ1 688 aa14.53□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 SEC31BQ9NQW1 1179 aa14.53□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 RAI14Q9P0K7 980 aa14.53□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 SNAP23O00161 211 aa14.52□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 DEXIO95424 95 aa14.52□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 FAM193AP78312 1265 aa14.52□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 DDR1Q08345 913 aa14.52□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 RASGRF1Q13972 1273 aa14.52□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 NR1I3Q14994 352 aa14.52□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 SLC10A5Q5PT55 438 aa14.52□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 TRIML1Q8N9V2 468 aa14.52□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 OXER1Q8TDS5 423 aa14.52□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 STAG1Q8WVM7 1258 aa14.52□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 CHD4Q14839 1912 aa14.52□□□□□ -0.08
SUCLG2-201ENST00000307227 LAMB2P55268 1798 aa14.52□□□□□ -0.09
SUCLG2-201ENST00000307227 SERPINB2P05120 415 aa14.52□□□□□ -0.09
SUCLG2-201ENST00000307227 NLGN1Q8N2Q7 840 aa14.52□□□□□ -0.09
SUCLG2-201ENST00000307227 CNBD1Q8NA66 436 aa14.52□□□□□ -0.09
SUCLG2-201ENST00000307227 KIFC2Q96AC6 838 aa14.52□□□□□ -0.09
SUCLG2-201ENST00000307227 DESI2Q9BSY9 194 aa14.52□□□□□ -0.09
SUCLG2-201ENST00000307227 CSRNP2Q9H175 543 aa14.52□□□□□ -0.09
SUCLG2-201ENST00000307227 MRFAP1Q9Y605 127 aa14.52□□□□□ -0.09
SUCLG2-201ENST00000307227 MROH5Q6ZUA9 1318 aa14.52□□□□□ -0.09
SUCLG2-201ENST00000307227 TAF1P21675 1872 aa14.51□□□□□ -0.09
SUCLG2-201ENST00000307227 ERICH4A6NGS2 130 aa14.51□□□□□ -0.09
SUCLG2-201ENST00000307227 TDO2P48775 406 aa14.51□□□□□ -0.09
SUCLG2-201ENST00000307227 PLCD1P51178 756 aa14.51□□□□□ -0.09
SUCLG2-201ENST00000307227 PPP2R3AQ06190 1150 aa14.51□□□□□ -0.09
SUCLG2-201ENST00000307227 SART3Q15020 963 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SUCLG2-201ENST00000307227 KANK3Q6NY19 840 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms