RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261889.9

SNX1-201, Transcript of sorting nexin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX1, Length 3,373 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1-201ENST00000261889 SHISA4Q96DD7 197 aa14.79□□□□□ -0.04
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SNX1-201ENST00000261889 NTRK3Q16288 839 aa14.79□□□□□ -0.04
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SNX1-201ENST00000261889 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.052e-6■■□□□ 13.8
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SNX1-201ENST00000261889 MMP1P03956 469 aa14.73□□□□□ -0.05
SNX1-201ENST00000261889 RASGRF1Q13972 1273 aa14.73□□□□□ -0.05
SNX1-201ENST00000261889 MFSD6Q6ZSS7 791 aa14.73□□□□□ -0.05
SNX1-201ENST00000261889 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SNX1-201ENST00000261889 EHD2Q9NZN4 543 aa14.73□□□□□ -0.05
SNX1-201ENST00000261889 MACROD2A1Z1Q3 448 aa14.73□□□□□ -0.05
SNX1-201ENST00000261889 PPP6R2O75170 966 aa14.73□□□□□ -0.05
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