RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
NME4-201ENST00000219479 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa26.19■■□□□ 1.78
NME4-201ENST00000219479 TAOK2Q9UL54 1235 aa26.19■■□□□ 1.78
NME4-201ENST00000219479 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
NME4-201ENST00000219479 COA7Q96BR5 231 aa26.18■■□□□ 1.78
NME4-201ENST00000219479 NR2E3Q9Y5X4 410 aa26.18■■□□□ 1.78
NME4-201ENST00000219479 TTC41PQ6P2S7 1318 aa26.17■■□□□ 1.78
NME4-201ENST00000219479 PLXNB2O15031 1838 aa26.17■■□□□ 1.78
NME4-201ENST00000219479 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
NME4-201ENST00000219479 KBTBD3Q8NAB2 608 aa26.17■■□□□ 1.78
NME4-201ENST00000219479 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa26.17■■□□□ 1.78
NME4-201ENST00000219479 PRKAB2O43741 272 aa26.16■■□□□ 1.78
NME4-201ENST00000219479 TFRCP02786 760 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
NME4-201ENST00000219479 CHGBP05060 677 aa26.16■■□□□ 1.78
NME4-201ENST00000219479 SHMT1P34896 483 aa26.16■■□□□ 1.78
NME4-201ENST00000219479 AAMPQ13685 434 aa26.16■■□□□ 1.78
NME4-201ENST00000219479 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
NME4-201ENST00000219479 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
NME4-201ENST00000219479 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
NME4-201ENST00000219479 ANKRD45Q5TZF3 282 aa26.15■■□□□ 1.78
NME4-201ENST00000219479 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa26.15■■□□□ 1.78
NME4-201ENST00000219479 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
NME4-201ENST00000219479 MYH1P12882 1939 aa26.15■■□□□ 1.78
NME4-201ENST00000219479 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
NME4-201ENST00000219479 CYP2D6P10635 497 aa26.14■■□□□ 1.78
NME4-201ENST00000219479 MX1P20591 662 aa26.14■■□□□ 1.78
NME4-201ENST00000219479 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
NME4-201ENST00000219479 USP17L2Q6R6M4 530 aa26.14■■□□□ 1.78
NME4-201ENST00000219479 SWAP70Q9UH65 585 aa26.14■■□□□ 1.78
NME4-201ENST00000219479 LAMA3Q16787 3333 aa26.13■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 CAPN2P17655 700 aa26.13■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 GABPAQ06546 454 aa26.13■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP26.13■■□□□ 1.779e-7■■■■□ 20.7
NME4-201ENST00000219479 NAV1Q8NEY1 1877 aa26.13■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 EVI5O60447 810 aa26.12■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 USP14P54578 494 aa26.12■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 EVX2Q03828 476 aa26.11■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 APPBP2Q92624 585 aa26.11■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 USP17L12C9JPN9 530 aa26.1■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 USP17L21D6R901 530 aa26.1■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 HMGCRP04035 888 aa26.1■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 DYNLL2Q96FJ2 89 aa26.1■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 FSD1Q9BTV5 496 aa26.1■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 EMILIN3Q9NT22 766 aa26.1■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 GJD2Q9UKL4 321 aa26.1■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 SEPT2Q15019 361 aa26.09■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 C12orf60Q5U649 245 aa26.09■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 SLC44A5Q8NCS7 719 aa26.09■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 PI4K2BQ8TCG2 481 aa26.09■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa26.08■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 TRIM32Q13049 653 aa26.08■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 OSBP2Q969R2 916 aa26.08■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa26.08■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 MORF4L1Q9UBU8 362 aa26.08■■□□□ 1.77
NME4-201ENST00000219479 A0A1W2PPC1 479 aa26.07■■□□□ 1.76
NME4-201ENST00000219479 HERVK_113P62684 666 aa26.07■■□□□ 1.76
NME4-201ENST00000219479 TMEM179Q6ZVK1 233 aa26.07■■□□□ 1.76
NME4-201ENST00000219479 NECAB2Q7Z6G3 386 aa26.07■■□□□ 1.76
NME4-201ENST00000219479 ACER1Q8TDN7 264 aa26.07■■□□□ 1.76
NME4-201ENST00000219479 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
NME4-201ENST00000219479 APPP05067 770 aa26.06■■□□□ 1.76
NME4-201ENST00000219479 GNAT2P19087 354 aa26.06■■□□□ 1.76
NME4-201ENST00000219479 CTR9Q6PD62 1173 aa26.06■■□□□ 1.76
NME4-201ENST00000219479 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
NME4-201ENST00000219479 C12orf42Q96LP6 360 aa26.06■■□□□ 1.76
NME4-201ENST00000219479 COL6A3P12111 3177 aa26.05■■□□□ 1.76
NME4-201ENST00000219479 USP17L15C9J2P7 530 aa26.05■■□□□ 1.76
NME4-201ENST00000219479 USP17L13C9JLJ4 530 aa26.05■■□□□ 1.76
NME4-201ENST00000219479 USP17L11C9JVI0 530 aa26.05■■□□□ 1.76
NME4-201ENST00000219479 USP17L18D6R9N7 530 aa26.05■■□□□ 1.76
NME4-201ENST00000219479 USP17L22D6RA61 530 aa26.05■■□□□ 1.76
NME4-201ENST00000219479 USP17L17D6RBQ6 530 aa26.05■■□□□ 1.76
NME4-201ENST00000219479 USP17L19D6RCP7 530 aa26.05■■□□□ 1.76
NME4-201ENST00000219479 USP17L20D6RJB6 530 aa26.05■■□□□ 1.76
NME4-201ENST00000219479 GPAA1O43292 621 aa26.05■■□□□ 1.76
NME4-201ENST00000219479 GUCY1A2P33402 732 aa26.05■■□□□ 1.76
NME4-201ENST00000219479 CDK8P49336 464 aa26.05■■□□□ 1.76
NME4-201ENST00000219479 USP17L24Q0WX57 530 aa26.05■■□□□ 1.76
NME4-201ENST00000219479 ANKLE1Q8NAG6 615 aa26.05■■□□□ 1.76
NME4-201ENST00000219479 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa26.05■■□□□ 1.76
NME4-201ENST00000219479 CCDC17Q96LX7 622 aa26.05■■□□□ 1.76
NME4-201ENST00000219479 STAP2Q9UGK3 403 aa26.05■■□□□ 1.76
NME4-201ENST00000219479 RPTORQ8N122 1335 aa26.05■■□□□ 1.76
NME4-201ENST00000219479 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
NME4-201ENST00000219479 PEX10O60683 326 aa26.04■■□□□ 1.76
NME4-201ENST00000219479 VCAM1P19320 739 aa26.04■■□□□ 1.76
NME4-201ENST00000219479 TDO2P48775 406 aa26.04■■□□□ 1.76
NME4-201ENST00000219479 GIMAP6Q6P9H5 292 aa26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms