RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000040676.10

Ankrd54-201, Transcript of Ankyrin repeat domain-containing protein 54, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd54, Length 1,904 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Vnn1Q9Z0K8 512 aa23.77■■□□□ 1.4
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Gm43738A0A0G2JEA5 862 aa23.76■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cyp26c1B2RXA7 518 aa23.76■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ift122Q6NWV3 1182 aa23.76■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Vps53Q8CCB4 832 aa23.76■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ints4Q8CIM8 964 aa23.76■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 OplahQ8K010 1288 aa23.76■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 MbipQ99LQ1 341 aa23.76■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Iqca1Q9CUL5 857 aa23.76■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Lonrf3Q9D4H7 753 aa23.76■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 PrkcshO08795 521 aa23.76■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ppef2O35385 757 aa23.76■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Il7P10168 154 aa23.76■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 SsbP32067 415 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Kiaa1468Q148V7 1216 aa23.76■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Fam178bQ24JP3 464 aa23.76■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Myo19Q5SV80 963 aa23.76■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Csrnp2Q8BGQ2 534 aa23.76■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Hexim1Q8R409 356 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Acad12D3Z7X0 555 aa23.75■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Zscan18E9PUD6 809 aa23.75■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Wnt7aP24383 349 aa23.75■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Atp6v1aP50516 617 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Nucb2P81117 420 aa23.75■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Trappc10Q3TLI0 1259 aa23.75■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Tm4sf1Q64302 202 aa23.75■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Lrrd1Q8C0R9 853 aa23.75■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Nrbp1Q99J45 535 aa23.75■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Lmbr1Q9JIT0 490 aa23.75■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Myh8P13542 1937 aa23.75■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Vmn2r68L7N2B3 851 aa23.74■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Kifc2O08672 792 aa23.74■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Slc7a1Q09143 622 aa23.74■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Myo1hQ9D6A1 958 aa23.74■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Polr2dQ9D7M8 142 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Znf287Q9EQB9 759 aa23.74■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Dctpp1Q9QY93 170 aa23.74■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Gm973E9Q295 1059 aa23.74■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Gm10134F6ZQC6 126 aa23.74■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 MarcksP26645 309 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Lrrc15Q80X72 579 aa23.74■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Znf18Q810A1 556 aa23.74■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ctdspl2Q8BG15 465 aa23.74■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Calml3Q9D6P8 149 aa23.74■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Grin2dQ03391 1323 aa23.73■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Api5O35841 504 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Chrna5Q2MKA5 467 aa23.73■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Slu7Q8BHJ9 585 aa23.73■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Lzts2Q91YU6 671 aa23.73■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Xrcc4Q924T3 326 aa23.73■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cnpy2Q9QXT0 182 aa23.73■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ecm29Q6PDI5 1840 aa23.73■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 PnnO35691 725 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Usp5P56399 858 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Gtf2f1Q3THK3 508 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Usp49Q6P9L4 685 aa23.72■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Vps16Q920Q4 839 aa23.72■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Zbed3Q9D0L1 228 aa23.72■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Tex13cD3YU32 604 aa23.72■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Gjb4Q02738 266 aa23.72■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Armc2Q3URY6 854 aa23.72■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Zkscan4Q5SZT6 480 aa23.72■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Atp2b4Q6Q477 1205 aa23.72■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Tlcd1Q99JT6 247 aa23.72■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Txnrd3Q99MD6 652 aa23.72■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Hip1rQ9JKY5 1068 aa23.72■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cd2apQ9JLQ0 637 aa23.72■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Alppl2P24823 529 aa23.71■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Pex1Q5BL07 1284 aa23.71■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ano6Q6P9J9 911 aa23.71■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Tacc1Q6Y685 774 aa23.71■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Luc7l2Q7TNC4 392 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cep85Q8BMK0 761 aa23.71■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Q8C6G1 249 aa23.71■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Zfp831A2ADM8 1628 aa23.71■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 C87499Q3UX49 493 aa23.71■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ncbp1Q3UYV9 790 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 GnptabQ69ZN6 1235 aa23.71■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Mxd3Q80US8 206 aa23.71■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Epha10Q8BYG9 1007 aa23.71■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Col23a1Q8K4G2 532 aa23.71■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Apobec3Q99J72 440 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Akap8Q9DBR0 687 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 A0A1W2P6Q8 802 aa23.7■■□□□ 1.38
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Gm9048A0A1W2P7H4 802 aa23.7■■□□□ 1.38
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 A0A1W2P7Z8 802 aa23.7■■□□□ 1.38
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Gm9046A0A1W2P855 802 aa23.7■■□□□ 1.38
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ces1aE9PYP1 563 aa23.7■■□□□ 1.38
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 CebpzP53569 1052 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Usp13Q5BKP2 858 aa23.7■■□□□ 1.38
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Nsrp1Q5NCR9 542 aa23.7■■□□□ 1.38
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Trmt2aQ8BNV1 574 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Kiaa1524Q8BWY9 907 aa23.7■■□□□ 1.38
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Nod2Q8K3Z0 1020 aa23.7■■□□□ 1.38
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Trim29Q8R2Q0 587 aa23.7■■□□□ 1.38
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Myoz2Q9JJW5 264 aa23.7■■□□□ 1.38
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Atp12aQ9Z1W8 1035 aa23.7■■□□□ 1.38
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Mtmr2Q9Z2D1 643 aa23.7■■□□□ 1.38
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Psmd10Q9Z2X2 231 aa23.7■■□□□ 1.38
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Eef2P58252 858 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.1 ms