RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026125.2

Alyref-201, Transcript of THO complex subunit 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Alyref, Length 3,527 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref-201ENSMUST00000026125 Rexo5D3YW29 759 aa20.2■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Brinp3Q499E0 766 aa20.2■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ubac1Q8VDI7 409 aa20.2■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Sar1bQ9CQC9 198 aa20.2■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Fut8Q9WTS2 575 aa20.2■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Znf697Q569E7 569 aa20.2■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Slc27a1Q60714 646 aa20.2■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ccp110Q7TSH4 1004 aa20.2■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Rufy1Q8BIJ7 712 aa20.2■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ccdc174Q3U155 467 aa20.19■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Naaladl2A0A0N4SUJ3 795 aa20.19■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Slc4a4O88343 1079 aa20.19■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Zrsr2Q62377 462 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Jmjd4Q8BFT6 427 aa20.19■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Tspyl4Q8VD63 406 aa20.19■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Trim34aQ99PP6 485 aa20.19■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ribc1Q9D0B8 379 aa20.19■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Mapk8ip1Q9WVI9 707 aa20.19■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Foxn2E9Q7L6 429 aa20.19■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Meis3P97368 378 aa20.19■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Txndc16Q7TN22 820 aa20.19■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 NelfbQ8C4Y3 580 aa20.19■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Trp53inp1Q9QXE4 239 aa20.19■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 PtprvP70289 1705 aa20.18■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Spata16Q8C636 571 aa20.18■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Vps37cQ8R105 352 aa20.18■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Osbpl1aQ91XL9 950 aa20.18■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ipo7Q9EPL8 1038 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 RabggtaQ9JHK4 567 aa20.18■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Copb1Q9JIF7 953 aa20.18■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Palm3A2TJV2 734 aa20.18■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Gm12185Q5NCB2 835 aa20.18■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ints5Q8CHT3 1018 aa20.18■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Klc3Q91W40 508 aa20.18■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Txndc5Q91W90 417 aa20.18■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 C5P06684 1680 aa20.18■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa20.18■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Fam107bQ3TGF2 131 aa20.18■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Tbc1d5Q80XQ2 815 aa20.18■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Lrsam1Q80ZI6 727 aa20.18■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Slitrk3Q810B9 980 aa20.18■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Sptlc3Q8BG54 563 aa20.18■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Trim29Q8R2Q0 587 aa20.18■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Dbndd2Q9CRD4 158 aa20.18■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ppfia4B8QI36 1187 aa20.17■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Usp5P56399 858 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Irak1Q62406 710 aa20.17■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ccdc148Q6P5U8 527 aa20.17■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Spag7Q7TNE3 227 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 KynuQ9CXF0 464 aa20.17■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 AvenQ9D9K3 342 aa20.17■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 AK157302I3ITR1 129 aa20.17■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 MycbpapQ5SUV2 932 aa20.17■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Prpf40bQ80W14 870 aa20.17■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Sugp2Q8CH09 1067 aa20.17■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Sash3Q8K352 380 aa20.17■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Isca1Q9D924 129 aa20.17■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Simc1E9Q6E9 1354 aa20.17■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Rbm5Q91YE7 815 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Cnpy3Q9DAU1 276 aa20.16■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Med23Q80YQ2 1367 aa20.16■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Pak1O88643 545 aa20.16■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Tpp1O89023 562 aa20.16■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Fam89aQ14BJ1 175 aa20.16■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ciao1Q99KN2 339 aa20.16■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 GscQ02591 256 aa20.16■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Trim6Q8BGE7 488 aa20.16■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Mkrn1Q9QXP6 481 aa20.16■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Robo1O89026 1612 aa20.16■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 4932429P05RikA2ADI4 785 aa20.15■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Otud7bB2RUR8 840 aa20.15■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Trim34bJ3QNR8 485 aa20.15■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Gfpt1P47856 697 aa20.15■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Cct6bQ61390 531 aa20.15■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Bpifb6Q8BU51 449 aa20.15■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Zbtb1Q91VL9 713 aa20.15■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Riok1Q922Q2 567 aa20.15■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 A0A1Y7VML8 143 aa20.15■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Cyp26c1B2RXA7 518 aa20.15■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Akap2O54931 893 aa20.15■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Rad23bP54728 416 aa20.15■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ifit1bl2Q3U687 466 aa20.15■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Dcaf5Q80T85 946 aa20.15■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Spice1Q8C804 860 aa20.15■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Leng8Q8CBY3 785 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Cgref1Q8R1U2 281 aa20.15■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 CpvlQ9D3S9 478 aa20.15■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Itga2bQ9QUM0 1033 aa20.15■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Scgb2b18A0A087WPA9 112 aa20.15■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 PpardP35396 440 aa20.15■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Tubb2aQ7TMM9 445 aa20.15■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ndufb9Q9CQJ8 179 aa20.15■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Tubb2bQ9CWF2 445 aa20.15■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Coro7Q9D2V7 922 aa20.15■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Lonrf3Q9D4H7 753 aa20.15■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Tube1Q9D6T1 475 aa20.15■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 C2cd2E9Q3C1 696 aa20.14■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Atp8b1Q148W0 1251 aa20.14■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Tsr1Q5SWD9 803 aa20.14■□□□□ 0.82
Alyref-201ENSMUST00000026125 Otop3Q80UF9 577 aa20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11.8 ms