RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000187120.1

Topbp1-ps1-201, mousemouse

BASIC

Gene Topbp1-ps1, Length 184 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Defb42Q8BVB5 75 aa-0,93□□□□□ -2,56
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 HilpdaQ9JLS0 64 aa-0,93□□□□□ -2,56
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Duox1A2AQ92 1551 aa-0,94□□□□□ -2,56
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rpl39lQ9CQD0 51 aa-0,94□□□□□ -2,56
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP-0,94□□□□□ -2,56
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Krtap20-2E9Q0A8 60 aa-0,95□□□□□ -2,56
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Adgrg4B7ZCC9 3073 aa-0,96□□□□□ -2,56
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 PlnP61014 52 aa-0,96□□□□□ -2,56
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Defb40Q70KL2 73 aa-0,96□□□□□ -2,56
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Abcc3B2RX12 1523 aa-0,96□□□□□ -2,56
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Cfap74Q3UY96 1578 aa-0,96□□□□□ -2,56
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gpr15lA0A0B4J1N3 78 aa-0,97□□□□□ -2,56
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm7173A0A0G2JEB6 3132 aa-0,97□□□□□ -2,56
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Smarca2Q6DIC0 1577 aa-0,97□□□□□ -2,56
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Muc4Q8JZM8 3443 aa-0,97□□□□□ -2,56
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Unc80Q8BLN6 3261 aa-0,98□□□□□ -2,57
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Dnah12Q3V0Q1 3086 aa-0,98□□□□□ -2,57
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Wfdc15aQ8BH89 80 aa-0,98□□□□□ -2,57
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 VcanQ62059 3357 aa-0,98□□□□□ -2,57
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm5108J3QP01 101 aa-1□□□□□ -2,57
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 PkiaP63248 76 aa-1□□□□□ -2,57
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa-1□□□□□ -2,57
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP-1□□□□□ -2,57
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Wfdc17Q5SSJ1 76 aa-1,01□□□□□ -2,57
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa-1,01□□□□□ -2,57
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Brca2P97929 3329 aa-1,01□□□□□ -2,57
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 TrioQ0KL02 3102 aa-1,02□□□□□ -2,57
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Defb30Q30KN4 75 aa-1,03□□□□□ -2,57
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm884A2A9H6 3643 aa-1,04□□□□□ -2,58
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Abca14E9Q8F8 1683 aa-1,04□□□□□ -2,58
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 DmdP11531 3678 aa-1,04□□□□□ -2,58
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa-1,05□□□□□ -2,58
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Szt2A2A9C3 3431 aa-1,05□□□□□ -2,58
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gcc2Q8CHG3 1679 aa-1,06□□□□□ -2,58
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 AspmQ8CJ27 3122 aa-1,08□□□□□ -2,58
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Lrrc37aB1AWG4 3215 aa-1,08□□□□□ -2,58
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 SpegQ62407 3262 aa-1,09□□□□□ -2,58
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Akap9Q70FJ1 3797 aa-1,1□□□□□ -2,59
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 IgipA0A1B0GR74 53 aa-1,11□□□□□ -2,59
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Defb36Q8K3U4 67 aa-1,11□□□□□ -2,59
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Sox19Q62249 55 aa-1,12□□□□□ -2,59
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tomm7Q9D173 55 aa-1,12□□□□□ -2,59
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Defb5Q9EPV9 64 aa-1,12□□□□□ -2,59
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Myo3aQ8K3H5 1613 aa-1,12□□□□□ -2,59
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Defb39Q70KL3 74 aa-1,15□□□□□ -2,59
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rpl39P62892 51 aa-1,16□□□□□ -2,6
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 P0C1Z5 52 aa-1,2□□□□□ -2,6
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Spef2Q8C9J3 1734 aa-1,23□□□□□ -2,61
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Wfdc18P62810 74 aa-1,23□□□□□ -2,61
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Defb43Q30KM9 69 aa-1,24□□□□□ -2,61
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Vps13aQ5H8C4 3166 aa-1,25□□□□□ -2,61
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm9789Q8BIG3 52 aa-1,27□□□□□ -2,61
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Akap12Q9WTQ5 1684 aa-1,28□□□□□ -2,61
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa-1,28□□□□□ -2,61
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Smim11aQ99J19 55 aa-1,28□□□□□ -2,61
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tomm5B1AXP6 51 aa-1,31□□□□□ -2,62
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm7735D3YX18 52 aa-1,31□□□□□ -2,62
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm6040Q4QY32 63 aa-1,31□□□□□ -2,62
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Dchs2A0A0A6YW72 3346 aa-1,32□□□□□ -2,62
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Cdh23Q99PF4 3354 aa-1,33□□□□□ -2,62
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tff3Q62395 81 aa-1,34□□□□□ -2,62
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 UtrnE9Q6R7 3430 aa-1,37□□□□□ -2,63
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tmem167aQ9CR64 72 aa-1,4□□□□□ -2,63
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Leap2Q91V13 76 aa-1,42□□□□□ -2,64
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 SnrpgP62309 76 aaKnown RBP-1,44□□□□□ -2,64
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 1810010D01RikA0A1L1SR87 51 aa-1,47□□□□□ -2,64
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 4930455H04RikD3Z622 58 aa-1,47□□□□□ -2,64
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Prm1P02319 51 aa-1,48□□□□□ -2,65
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm9999Q8C5Y2 53 aa-1,53□□□□□ -2,65
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Defb7Q91V70 71 aa-1,56□□□□□ -2,66
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Defb46Q4QY34 57 aa-1,58□□□□□ -2,66
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Golgb1E9PVZ8 3238 aa-1,58□□□□□ -2,66
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 ApelaP0DMC4 54 aa-1,6□□□□□ -2,67
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Defb4P82019 63 aa-1,6□□□□□ -2,67
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Cox14Q8BH51 57 aa-1,6□□□□□ -2,67
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Phxr1P15973 60 aa-1,66□□□□□ -2,68
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Smim37Q8BT35 56 aa-1,68□□□□□ -2,68
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Defb8Q91V82 60 aa-1,7□□□□□ -2,68
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Defb3Q9WTL0 63 aa-1,82□□□□□ -2,7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Defb6Q91VD6 63 aa-1,92□□□□□ -2,72
Retrieved 80 of 22,080 RNA–protein pairs in 63 ms