Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Y2

Gm9999, Predicted gene 9999, mousemouse

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Length 53 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9999Q8C5Y2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Gm9999Q8C5Y2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Gm9999Q8C5Y2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gm9999Q8C5Y2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gm9999Q8C5Y2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gm9999Q8C5Y2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gm9999Q8C5Y2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Gm9999Q8C5Y2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Gm9999Q8C5Y2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gm9999Q8C5Y2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Gm9999Q8C5Y2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gm9999Q8C5Y2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm9999Q8C5Y2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gm9999Q8C5Y2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Gm9999Q8C5Y2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Gm9999Q8C5Y2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gm9999Q8C5Y2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gm9999Q8C5Y2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm9999Q8C5Y2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm9999Q8C5Y2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Gm9999Q8C5Y2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gm9999Q8C5Y2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm9999Q8C5Y2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gm9999Q8C5Y2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm9999Q8C5Y2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm9999Q8C5Y2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm9999Q8C5Y2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm9999Q8C5Y2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm9999Q8C5Y2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm9999Q8C5Y2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm9999Q8C5Y2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gm9999Q8C5Y2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gm9999Q8C5Y2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm9999Q8C5Y2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm9999Q8C5Y2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gm9999Q8C5Y2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gm9999Q8C5Y2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gm9999Q8C5Y2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm9999Q8C5Y2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gm9999Q8C5Y2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm9999Q8C5Y2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Gm9999Q8C5Y2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm9999Q8C5Y2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm9999Q8C5Y2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm9999Q8C5Y2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm9999Q8C5Y2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm9999Q8C5Y2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm9999Q8C5Y2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm9999Q8C5Y2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm9999Q8C5Y2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm9999Q8C5Y2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm9999Q8C5Y2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm9999Q8C5Y2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm9999Q8C5Y2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm9999Q8C5Y2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm9999Q8C5Y2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm9999Q8C5Y2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm9999Q8C5Y2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm9999Q8C5Y2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm9999Q8C5Y2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm9999Q8C5Y2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm9999Q8C5Y2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm9999Q8C5Y2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm9999Q8C5Y2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm9999Q8C5Y2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gm9999Q8C5Y2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm9999Q8C5Y2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm9999Q8C5Y2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm9999Q8C5Y2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm9999Q8C5Y2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm9999Q8C5Y2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm9999Q8C5Y2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm9999Q8C5Y2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm9999Q8C5Y2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm9999Q8C5Y2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm9999Q8C5Y2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm9999Q8C5Y2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm9999Q8C5Y2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm9999Q8C5Y2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm9999Q8C5Y2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm9999Q8C5Y2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Gm9999Q8C5Y2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm9999Q8C5Y2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm9999Q8C5Y2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm9999Q8C5Y2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm9999Q8C5Y2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm9999Q8C5Y2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm9999Q8C5Y2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm9999Q8C5Y2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm9999Q8C5Y2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm9999Q8C5Y2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm9999Q8C5Y2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm9999Q8C5Y2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm9999Q8C5Y2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm9999Q8C5Y2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm9999Q8C5Y2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm9999Q8C5Y2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm9999Q8C5Y2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm9999Q8C5Y2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm9999Q8C5Y2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
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