RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047993.9

Hoxa13-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Hoxa13, Length 1,309 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Krtap3-1A2A591 98 aa11,79□□□□□ -0,52
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Krtap4-9B1AQA9 244 aa11,78□□□□□ -0,52
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Bud31Q6PGH1 103 aa11,78□□□□□ -0,52
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Pxt1Q8K459 51 aa11,78□□□□□ -0,52
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Pla2g10Q9QXX3 151 aa11,77□□□□□ -0,53
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Spint4Q9D263 159 aa11,76□□□□□ -0,53
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Fsip2A2ARZ3 6995 aa11,72□□□□□ -0,53
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Defb1P56386 69 aa11,63□□□□□ -0,55
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Prm2P07978 107 aa11,61□□□□□ -0,55
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ndufc1Q9CQY9 76 aa11,6□□□□□ -0,55
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm6358A0A087WPH4 74 aa11,59□□□□□ -0,55
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Krtap19-9aF8WH65 55 aa11,55□□□□□ -0,56
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Mt4P47945 62 aa11,55□□□□□ -0,56
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm10160F6Y577 67 aa11,51□□□□□ -0,57
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Atox1O08997 68 aaKnown RBP11,49□□□□□ -0,57
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm17606F6ZL36 78 aa11,46□□□□□ -0,57
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 BC029722A0A0N4SW31 51 aa11,42□□□□□ -0,58
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Cox6b2Q80ZN9 88 aa11,42□□□□□ -0,58
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm10643Q3URG9 111 aa11,39□□□□□ -0,59
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Krtap4-13Q9D7P3 165 aa11,37□□□□□ -0,59
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Krtap6-3A0A087WQL6 57 aa11,36□□□□□ -0,59
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Spink7Q6IE32 76 aa11,28□□□□□ -0,6
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm20537G3UYK7 97 aa11,27□□□□□ -0,61
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Fam240bJ3QMB3 78 aa11,27□□□□□ -0,61
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 CriptO70333 101 aa11,26□□□□□ -0,61
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 4930518I15RikQ3V2W7 57 aa11,25□□□□□ -0,61
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Coa6Q8BGD8 79 aa11,25□□□□□ -0,61
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm10382Q3V0T5 144 aa11,23□□□□□ -0,61
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Lce1iQ9D6P5 149 aa11,18□□□□□ -0,62
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 SptssbQ925E8 76 aa11,16□□□□□ -0,62
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Krtap9-3Q3V2C1 136 aa11,13□□□□□ -0,63
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 B230307C23RikQ8BLB2 64 aa11,09□□□□□ -0,63
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Sprr2kO70562 68 aa11,09□□□□□ -0,63
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm45213A0A0U1RNZ6 101 aa11,05□□□□□ -0,64
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Atp5eP56382 52 aa11,03□□□□□ -0,64
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Serp2Q6TAW2 65 aa10,98□□□□□ -0,65
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Limd2Q8BGB5 128 aa10,98□□□□□ -0,65
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Lce1lQ9D1G7 135 aa10,98□□□□□ -0,65
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Lce1a2Q9D1K4 149 aa10,98□□□□□ -0,65
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Mt2P02798 61 aa10,96□□□□□ -0,65
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Lce1bQ9D149 137 aa10,89□□□□□ -0,67
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Coa5Q99M07 74 aa10,88□□□□□ -0,67
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Krtap8-1O08633 61 aa10,84□□□□□ -0,67
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 2300003K06RikA2A4M0 262 aa10,83□□□□□ -0,68
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm38119A0A0A6YX29 146 aa10,81□□□□□ -0,68
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Krtap4-7Q9D732 168 aa10,73□□□□□ -0,69
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Anapc13Q8R034 74 aa10,62□□□□□ -0,71
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Smim20D3Z7Q2 69 aa10,57□□□□□ -0,72
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm20661K7N787 53 aa10,56□□□□□ -0,72
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Sprr2a3Q4KL71 83 aa10,51□□□□□ -0,73
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Sprr2a1Q9CQK8 83 aa10,51□□□□□ -0,73
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Lce1a1Q9CQH5 143 aa10,46□□□□□ -0,73
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Krtap22-2J3QNX6 67 aa10,43□□□□□ -0,74
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Sprr2gO70558 76 aa10,39□□□□□ -0,75
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Krtap20-2E9Q0A8 60 aa10,36□□□□□ -0,75
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Lce1hQ9D6R3 140 aa10,34□□□□□ -0,75
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Sec61gP60060 68 aa10,33□□□□□ -0,76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Serp1Q9Z1W5 66 aa10,31□□□□□ -0,76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 H2al1aQ5M8Q2 105 aa10,29□□□□□ -0,76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 H2al1eQ810S6 105 aa10,29□□□□□ -0,76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Lce1eQ9D139 143 aa10,28□□□□□ -0,76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm17402F6Z0L5 76 aa10,26□□□□□ -0,77
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Smlr1J3QMJ4 66 aa10,26□□□□□ -0,77
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm9955Q8CEJ8 102 aa10,26□□□□□ -0,77
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 SnurfQ9WU12 71 aa10,24□□□□□ -0,77
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm19668J3QMD1 248 aa10,2□□□□□ -0,78
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Pet100P0DJE0 76 aa10,13□□□□□ -0,79
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 2310046K23RikA0A0A6YVW6 87 aa10,11□□□□□ -0,79
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Prr13Q9CQJ5 137 aa10,09□□□□□ -0,79
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Uqcr11Q9CPX8 56 aa10,07□□□□□ -0,8
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Cdc42se1Q8BHL7 80 aa10,06□□□□□ -0,8
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 H2al1bA0A087WP11 105 aa9,99□□□□□ -0,81
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm10197F6QEY5 67 aa9,98□□□□□ -0,81
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Phxr4P15974 95 aa9,9□□□□□ -0,82
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Eppk1Q8R0W0 6548 aa9,87□□□□□ -0,83
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm21887J3QQ04 176 aa9,84□□□□□ -0,83
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Tmem258P61166 79 aa9,82□□□□□ -0,84
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Krtap19-9bQ99NG9 58 aa9,82□□□□□ -0,84
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Camk2n1Q6QWF9 78 aa9,7□□□□□ -0,86
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ndufb1P0DN34 57 aa9,68□□□□□ -0,86
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm19935A0A1B0GSF9 52 aa9,64□□□□□ -0,87
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 A0A1Y7VJH8 109 aa9,61□□□□□ -0,87
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Lce1dQ9D731 133 aa9,6□□□□□ -0,87
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Brk1Q91VR8 75 aa9,56□□□□□ -0,88
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm11559Q9D3H7 191 aa9,44□□□□□ -0,9
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Krtap5-2Q9D5Z7 189 aa9,4□□□□□ -0,9
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 A030005L19RikA0A1Y7VIU2 113 aa9,38□□□□□ -0,91
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm11554B1AQB2 190 aa9,38□□□□□ -0,91
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm11639A0A1D5RLM8 5808 aa9,35□□□□□ -0,91
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Macf1Q9QXZ0 7354 aaKnown RBP9,32□□□□□ -0,92
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Sprr2iO70560 76 aa9,31□□□□□ -0,92
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Lce1kJ3QP15 125 aa9,27□□□□□ -0,93
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm3880A0A1B0GSB3 72 aa9,23□□□□□ -0,93
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Kmt2dQ6PDK2 5588 aa9,15□□□□□ -0,95
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm4553A0A1B0GSA9 284 aa9,06□□□□□ -0,96
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 H2al1kJ3QP08 105 aa9,06□□□□□ -0,96
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Syne1Q6ZWR6 8799 aa9,04□□□□□ -0,96
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 H2al1mQ9DAD9 105 aa9,02□□□□□ -0,97
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 SmcpP15265 143 aa8,99□□□□□ -0,97
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gpr98Q8VHN7 6298 aaKnown RBP8,98□□□□□ -0,97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10,2 ms