RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000023054.13

Apobec3-201, Transcript of DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Apobec3, Length 1,842 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3-201ENSMUST00000023054 4930507D05RikQ8C9C9 103 aa5.14□□□□□ -1.59
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Apobec3-201ENSMUST00000023054 Vps13bQ80TY5 3993 aa5.14□□□□□ -1.59
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm5767A0A0J9YTU8 78 aa5.13□□□□□ -1.59
Apobec3-201ENSMUST00000023054 A930033H14RikG5E8X6 103 aa5.12□□□□□ -1.59
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm4491E0CX42 125 aa5.11□□□□□ -1.59
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ryr1E9PZQ0 5035 aa5.11□□□□□ -1.59
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Kmt2cQ8BRH4 4903 aa5.11□□□□□ -1.59
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Apobec3-201ENSMUST00000023054 Dnhd1D3Z2X2 4750 aa4.92□□□□□ -1.62
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Mycbp2Q7TPH6 4711 aa4.91□□□□□ -1.62
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Apobec3-201ENSMUST00000023054 Birc6O88738 4882 aa4.85□□□□□ -1.63
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Apobec3-201ENSMUST00000023054 Krtap4-9B1AQA9 244 aa4.81□□□□□ -1.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm20537G3UYK7 97 aa4.79□□□□□ -1.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Mp68P56379 58 aa4.76□□□□□ -1.65
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Lce1lQ9D1G7 135 aa4.76□□□□□ -1.65
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm11569B1AQB1 180 aa4.75□□□□□ -1.65
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Apobec3-201ENSMUST00000023054 Romo1P60603 79 aa4.75□□□□□ -1.65
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm3880A0A1B0GSB3 72 aa4.74□□□□□ -1.65
Apobec3-201ENSMUST00000023054 HydinQ80W93 5154 aa4.7□□□□□ -1.66
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Lce1eQ9D139 143 aa4.69□□□□□ -1.66
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Apobec3-201ENSMUST00000023054 Lrp2A2ARV4 4660 aa4.68□□□□□ -1.66
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Apobec3-201ENSMUST00000023054 Krtap13-1Q8K198 168 aa4.59□□□□□ -1.67
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Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm19426M0QWC7 77 aa4.41□□□□□ -1.7
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Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm11567Q9D141 195 aa4.37□□□□□ -1.71
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Apobec3-201ENSMUST00000023054 Prm1P02319 51 aa4.34□□□□□ -1.71
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Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm9789Q8BIG3 52 aa4.33□□□□□ -1.72
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm10318A0A1W2P728 225 aa4.32□□□□□ -1.72
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Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm11595B1AQA7 289 aa4.25□□□□□ -1.73
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Krtap1-4Q3V2D6 188 aa4.25□□□□□ -1.73
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Apobec3-201ENSMUST00000023054 4932415D10RikA0A1W2P6U8 4986 aa4.19□□□□□ -1.74
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Apobec3-201ENSMUST00000023054 Lce1fB9EJP6 147 aa4.1□□□□□ -1.75
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Krtap12-1Q9Z287 130 aa4.1□□□□□ -1.75
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Krtap19-9aF8WH65 55 aa4.09□□□□□ -1.75
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Rnf213E9Q555 5152 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.76
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Camk2n1Q6QWF9 78 aa4.08□□□□□ -1.76
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Fat4Q2PZL6 4981 aa4.06□□□□□ -1.76
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm9112A2AI92 75 aa4.04□□□□□ -1.76
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm10100J3QK64 120 aa4.03□□□□□ -1.76
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Krtap5-4Q62220 223 aa4□□□□□ -1.77
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