RNA–Protein interactions for RNA: YNL233W

BNI4, Transcript of Targeting subunit for Glc7p protein phosphatase, yeast

Gene BNI4, Length 2,679 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BNI4	YNL233W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	MUB1	Q03162	620 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	SSY1	Q03770	852 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	SKG3	Q06315	1026 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	TGL5	Q12043	749 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	KAR3	P17119	729 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	LYS9	P38999	446 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	YEL057C	P39983	233 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.18	□□□□□ -1.9	not detected
BNI4	YNL233W	YGR066C	P53242	292 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	JJJ1	P53863	590 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	SEC5	P89102	971 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	OAZ1	Q02803	292 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	ESC8	Q08119	714 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	NFI1	Q12216	726 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	RKR1	Q04781	1562 aa		3.18	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.17	□□□□□ -1.9	not detected
BNI4	YNL233W	VPS33	P20795	691 aa		3.17	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	POL4	P25615	582 aa		3.17	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	DCG1	P32460	244 aa		3.17	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	UBP13	P38187	747 aa		3.17	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	FTH1	P38310	465 aa		3.17	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	YJL193W	P39542	402 aa		3.17	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	JHD1	P40034	492 aa		3.17	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	ZIM17	P42844	174 aa		3.17	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	THI22	Q06490	572 aa		3.17	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	TCO89	Q08921	799 aa		3.17	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		3.17	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.17	□□□□□ -1.9	not detected
BNI4	YNL233W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	PEX1	P24004	1043 aa		3.17	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	MGM1	P32266	881 aa		3.17	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	MAL33	P38157	468 aa		3.17	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	VID24	P38263	362 aa		3.17	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	THI6	P41835	540 aa		3.17	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	MET12	P46151	657 aa		3.17	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	EOS1	P53938	366 aa		3.17	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	CDC25	P04821	1589 aa		3.17	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	APE1	P14904	514 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	DSS4	P32601	143 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	SWH1	P35845	1188 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	SAF1	P38352	637 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	RRF1	P38771	230 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	GET2	P40056	285 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	MET28	P40573	187 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	COS12	P53053	380 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	INN1	P53901	409 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	HOF1	Q05080	669 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	STP3	Q05937	343 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	PEX19	Q07418	342 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	FRE6	Q12473	712 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	HIS5	P07172	385 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	STE12	P13574	688 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	VPS34	P22543	875 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	YCR051W	P25631	222 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	TOS1	P38288	455 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	COS111	P38308	924 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	RPP1	P38786	293 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	LRO1	P40345	661 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	YIL077C	P40508	320 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	DOT5	P40553	215 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	GCV2	P49095	1034 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	YML037C	Q03703	340 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	RSF1	Q05043	376 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	YEH1	Q07804	573 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	REX3	Q12090	404 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	SWT1	Q12104	458 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	TRM11	Q12463	433 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	SMI1	P32566	505 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	MAM1	P40065	302 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	TMN3	P40071	706 aa		3.16	□□□□□ -1.9
BNI4	YNL233W	NCS6	P53088	359 aa		3.16	□□□□□ -1.9

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.9 ms