RNA–Protein interactions for RNA: YHR167W

THP2, Transcript of Subunit of the THO and TREX complexes, yeast

Gene THP2, Length 786 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
THP2	YHR167W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.08	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	MBR1	P23493	339 aa		4.07	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	RPC34	P32910	317 aa		4.07	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	YAP3	P38749	330 aa		4.07	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	UBX4	P54730	416 aa		4.07	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	LCB4	Q12246	624 aa		4.07	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.07	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	TY1B-JR2	P47100	1755 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	TY1B-ER2	Q03619	1755 aa		4.07	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	TY1B-MR1	Q04214	1755 aa		4.07	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	TY1B-MR2	Q04670	1755 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	TY1B-LR1	Q12088	1755 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	TY1B-NL1	Q12112	1755 aa		4.07	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	TY1B-GR1	Q12141	1755 aa		4.07	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	TY1B-BL	Q12490	1755 aa		4.07	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	ERG11	P10614	530 aa		4.06	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	POL3	P15436	1097 aa		4.06	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	RIT1	P23796	513 aa		4.06	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	MAM1	P40065	302 aa		4.06	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	OPT1	P40897	799 aa		4.06	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	YJL043W	P47053	257 aa		4.06	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	UBP16	Q02863	499 aa		4.06	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	HRD3	Q05787	833 aa		4.06	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	THI7	Q05998	598 aa		4.06	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	MSH1	P25846	959 aa		4.05	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	GSY2	P27472	705 aa		4.05	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	ORC2	P32833	620 aa		4.05	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	YBR138C	P38277	524 aa		4.05	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	CAB2	P40506	365 aa		4.05	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	BST1	P43571	1029 aa		4.05	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	SAE2	P46946	345 aa		4.05	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	CIA1	Q05583	330 aa		4.05	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	CYK3	Q07533	885 aa		4.05	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.05	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.05	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	YSP2	Q06681	1438 aa		4.04	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		4.04	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		4.04	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		4.04	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	MTG2	P38860	518 aa		4.04	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	LNP1	P38878	278 aa		4.04	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	ACA1	P39970	489 aa		4.04	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	LAS21	P40367	830 aa		4.04	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	IMA1	P53051	589 aa		4.04	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	COG2	P53271	262 aa		4.04	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	YML053C	Q04978	212 aa		4.04	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	BIK1	P11709	440 aa		4.03	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	PHO81	P17442	1178 aa		4.03	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	ERC1	P38767	581 aa		4.03	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	PUG1	P40100	303 aa		4.03	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	RAD26	P40352	1085 aa		4.03	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	TAM41	P53230	385 aa		4.03	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	MAK10	Q02197	733 aa		4.03	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	SUL2	Q12325	893 aa		4.03	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	FRE7	Q12333	620 aa		4.03	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.03	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.03	□□□□□ -1.76
THP2	YHR167W	IRC20	Q06554	1556 aa		4.02	□□□□□ -1.77
THP2	YHR167W	PDR12	Q02785	1511 aa		4.02	□□□□□ -1.77
THP2	YHR167W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
THP2	YHR167W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
THP2	YHR167W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
THP2	YHR167W	RIM13	Q03792	727 aa		4.02	□□□□□ -1.77
THP2	YHR167W	ARA2	Q04212	335 aa		4.02	□□□□□ -1.77
THP2	YHR167W	PLM2	Q04383	521 aa		4.02	□□□□□ -1.77
THP2	YHR167W	BSP1	Q06604	576 aa		4.02	□□□□□ -1.77
THP2	YHR167W	TRM3	Q07527	1436 aa		4.02	□□□□□ -1.77
THP2	YHR167W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
THP2	YHR167W	NUP1	P20676	1076 aa		4.01	□□□□□ -1.77
THP2	YHR167W	PDE1	P22434	369 aa		4.01	□□□□□ -1.77
THP2	YHR167W	MSM1	P22438	575 aa		4.01	□□□□□ -1.77
THP2	YHR167W	APN1	P22936	367 aa		4.01	□□□□□ -1.77
THP2	YHR167W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
THP2	YHR167W	APD1	P38281	316 aa		4.01	□□□□□ -1.77
THP2	YHR167W	IES5	P40060	125 aa		4.01	□□□□□ -1.77
THP2	YHR167W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
THP2	YHR167W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
THP2	YHR167W	SEG1	Q04279	960 aa		4.01	□□□□□ -1.77
THP2	YHR167W	RAD34	Q06665	692 aa		4.01	□□□□□ -1.77
THP2	YHR167W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
THP2	YHR167W	DOP1	Q03921	1698 aa		4	□□□□□ -1.77

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