RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W TDP1P38319 544 aa12.89□□□□□ -0.35
SSA4YER103W MGS1P40151 587 aa12.89□□□□□ -0.35
SSA4YER103W YFL012WP43580 148 aa12.89□□□□□ -0.35
SSA4YER103W GLO2Q05584 274 aa12.89□□□□□ -0.35
SSA4YER103W YEL077CQ3E7X8 1277 aa12.89□□□□□ -0.35
SSA4YER103W SAC1P32368 623 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
SSA4YER103W PEX6P33760 1030 aa12.88□□□□□ -0.35
SSA4YER103W VPS21P36017 210 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
SSA4YER103W EAP1P36041 632 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
SSA4YER103W SWC5P38326 303 aa12.88□□□□□ -0.35
SSA4YER103W MEF2P39677 819 aa12.88□□□□□ -0.35
SSA4YER103W VHR2P40041 505 aa12.88□□□□□ -0.35
SSA4YER103W AVT1P47082 602 aa12.88□□□□□ -0.35
SSA4YER103W ROD1Q02805 837 aa12.88□□□□□ -0.35
SSA4YER103W FMP45Q07651 309 aa12.88□□□□□ -0.35
SSA4YER103W GPI13Q07830 1017 aa12.88□□□□□ -0.35
SSA4YER103W RSB1Q08417 382 aa12.88□□□□□ -0.35
SSA4YER103W NCR1Q12200 1170 aa12.88□□□□□ -0.35
SSA4YER103W SPE1P08432 466 aa12.88□□□□□ -0.35
SSA4YER103W MRP13P12686 339 aa12.88□□□□□ -0.35
SSA4YER103W YCR015CP25616 317 aa12.88□□□□□ -0.35
SSA4YER103W CMK1P27466 446 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
SSA4YER103W AEP1P32493 518 aa12.88□□□□□ -0.35
SSA4YER103W NUP2P32499 720 aa12.88□□□□□ -0.35
SSA4YER103W QNS1P38795 714 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
SSA4YER103W GDH3P39708 457 aa12.88□□□□□ -0.35
SSA4YER103W NPR2P39923 615 aa12.88□□□□□ -0.35
SSA4YER103W YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
SSA4YER103W TRS130Q03660 1102 aa12.88□□□□□ -0.35
SSA4YER103W RCF1Q03713 159 aa12.88□□□□□ -0.35
SSA4YER103W GMC2Q06201 188 aa12.88□□□□□ -0.35
SSA4YER103W CRD1Q07560 283 aa12.88□□□□□ -0.35
SSA4YER103W BRE4Q07660 1125 aa12.88□□□□□ -0.35
SSA4YER103W RHO2P06781 192 aa12.87□□□□□ -0.35
SSA4YER103W FBA1P14540 359 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
SSA4YER103W ATP7P30902 174 aa12.87□□□□□ -0.35
SSA4YER103W RDH54P38086 958 aa12.87□□□□□ -0.35
SSA4YER103W YBL086CP38177 466 aa12.87□□□□□ -0.35
SSA4YER103W YBL028CP38202 106 aa12.87□□□□□ -0.35
SSA4YER103W PEA2P40091 420 aa12.87□□□□□ -0.35
SSA4YER103W PEX8P53248 589 aa12.87□□□□□ -0.35
SSA4YER103W YMR160WQ03823 816 aa12.87□□□□□ -0.35
SSA4YER103W SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
SSA4YER103W REH1Q06709 432 aa12.87□□□□□ -0.35
SSA4YER103W PUS7Q08647 676 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
SSA4YER103W MUM3Q08750 479 aa12.87□□□□□ -0.35
SSA4YER103W RPL6BP05739 176 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
SSA4YER103W MSS18P08593 268 aa12.86□□□□□ -0.35
SSA4YER103W HXT15P54854 567 aa12.86□□□□□ -0.35
SSA4YER103W CDC55Q00362 526 aa12.86□□□□□ -0.35
SSA4YER103W ABZ2Q03266 374 aa12.86□□□□□ -0.35
SSA4YER103W ULA1Q12059 462 aa12.86□□□□□ -0.35
SSA4YER103W GIS3Q12418 502 aa12.86□□□□□ -0.35
SSA4YER103W CMK2P22517 447 aa12.86□□□□□ -0.35
SSA4YER103W RFS1P38234 210 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
SSA4YER103W BOL3P39724 118 aa12.86□□□□□ -0.35
SSA4YER103W BIR1P47134 954 aa12.86□□□□□ -0.35
SSA4YER103W LIF1P53150 421 aa12.86□□□□□ -0.35
SSA4YER103W YGL039WP53183 348 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
SSA4YER103W ARC35P53731 342 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
SSA4YER103W HSP31Q04432 237 aa12.86□□□□□ -0.35
SSA4YER103W YLL056CQ12177 298 aa12.86□□□□□ -0.35
SSA4YER103W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
SSA4YER103W YBL113CQ7M4S9 792 aa12.86□□□□□ -0.35
SSA4YER103W ATP6P00854 259 aa12.85□□□□□ -0.35
SSA4YER103W HSC82P15108 705 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
SSA4YER103W COX11P19516 300 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
SSA4YER103W SRB2P34162 210 aa12.85□□□□□ -0.35
SSA4YER103W ATG12P38316 186 aa12.85□□□□□ -0.35
SSA4YER103W MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data12.85□□□□□ -0.35not detected
SSA4YER103W RSN1Q03516 953 aa12.85□□□□□ -0.35
SSA4YER103W JIP5Q06214 492 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
SSA4YER103W YPL191CQ08930 360 aa12.85□□□□□ -0.35
SSA4YER103W GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data12.84□□□□□ -0.35not detected
SSA4YER103W RPC34P32910 317 aa12.84□□□□□ -0.35
SSA4YER103W PTC1P35182 281 aa12.84□□□□□ -0.35
SSA4YER103W APN2P38207 520 aa12.84□□□□□ -0.35
SSA4YER103W ARN1P38731 627 aa12.84□□□□□ -0.35
SSA4YER103W KRE29P40026 464 aa12.84□□□□□ -0.35
SSA4YER103W YNR063WP53749 607 aa12.84□□□□□ -0.35
SSA4YER103W GPD1Q00055 391 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
SSA4YER103W SPH1Q06160 661 aa12.84□□□□□ -0.35
SSA4YER103W YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
SSA4YER103W FLC1Q08967 793 aa12.84□□□□□ -0.35
SSA4YER103W YMR030W-AQ3E760 96 aa12.84□□□□□ -0.35
SSA4YER103W BCY1P07278 416 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
SSA4YER103W SSA4P22202 642 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
SSA4YER103W TSR4P25040 408 aa12.84□□□□□ -0.35
SSA4YER103W HSP30P25619 332 aa12.84□□□□□ -0.35
SSA4YER103W CSM1P25651 190 aa12.84□□□□□ -0.35
SSA4YER103W SBA1P28707 216 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
SSA4YER103W MOT1P32333 1867 aa12.84□□□□□ -0.35
SSA4YER103W DAL1P32375 460 aa12.84□□□□□ -0.35
SSA4YER103W COT1P32798 439 aa12.84□□□□□ -0.35
SSA4YER103W CRP1P38845 465 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
SSA4YER103W AVT2P39981 480 aa12.84□□□□□ -0.35
SSA4YER103W YGR266WP53326 701 aa12.84□□□□□ -0.35
SSA4YER103W RSC9Q03124 581 aa12.84□□□□□ -0.35
SSA4YER103W PSR1Q07800 427 aa12.84□□□□□ -0.35
SSA4YER103W YEH2Q07950 538 aa12.84□□□□□ -0.35
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