RNA–Protein interactions for RNA: Q0050

AI1, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI1, Length 2,505 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI1	Q0050	MAS2	P11914	482 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	ABF1	P14164	731 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	MCM2	P29469	868 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YKL102C	P34249	101 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	WSC4	P38739	605 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	MTG2	P38860	518 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	DUN1	P39009	513 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	GDH3	P39708	457 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YEL025C	P39991	1188 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	NDC80	P40460	691 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YIR042C	P40586	236 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	THI6	P41835	540 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	PFA3	P42836	336 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YNL050C	P53952	270 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	NUP53	Q03790	475 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YHM2	Q04013	314 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	THI21	Q08975	551 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	SKM1	Q12469	655 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	HOM3	P10869	527 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	REV1	P12689	985 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	KIN82	P25341	720 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	SPC29	P33419	253 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	KDX1	P36005	433 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	TVP38	P36164	337 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	ATG12	P38316	186 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	MUP3	P38734	546 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	MBP1	P39678	833 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	KHA1	P40309	873 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	UBP7	P40453	1071 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	BST1	P43571	1029 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	TY4A-J	P47023	414 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	HXT16	P47185	567 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	MRX6	P48564	524 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	HUL5	P53119	910 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	MAL12	P53341	584 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	TOF2	Q02208	771 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	ARG7	Q04728	441 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YMR321C	Q04898	105 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	ORM2	Q06144	216 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YCG1	Q06680	1035 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	ALE1	Q08548	619 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	OXR1	Q08952	273 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	SRO7	Q12038	1033 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	SPO24	Q3E752	67 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YLR415C	O13578	112 aa		0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	CIT1	P00890	479 aa		0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	OM45	P16547	393 aa		0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	CLC1	P17891	233 aa		0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	ADH7	P25377	361 aa		0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YIM1	P28625	365 aa		0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	CCL1	P37366	393 aa		0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YBR139W	P38109	508 aa		0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	REG2	P38232	338 aa		0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YHR078W	P38799	552 aa		0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	SPC97	P38863	823 aa		0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	FAD1	P38913	306 aa		0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	DSN1	P40568	576 aa		0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	IES1	P43579	692 aa		0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	RMD8	P43620	662 aa		0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	NPA3	P47122	385 aa		0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	SGF73	P53165	657 aa		0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	SNF12	P53628	566 aa		0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	RMD1	Q03441	430 aa		0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	PLP2	Q12017	286 aa		0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	IRA2	P19158	3079 aa		0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	ELO2	P25358	347 aa		0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	BUD14	P27637	709 aa		0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	ATO2	P32907	282 aa		0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	PHO11	P35842	467 aa		0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	KKQ8	P36004	724 aa		0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	PET10	P36139	283 aa		0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YBR284W	P38150	797 aa		0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	PHO12	P38693	467 aa		0.56	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.56	□□□□□ -2.32	not detected

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