RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640888.1

LIAS-222, Transcript of lipoic acid synthetase, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIAS, Length 4,041 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LIAS-222	ENST00000640888	STK36	Q9NRP7	1315 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	GUCY1A2	P33402	732 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	DDR1	Q08345	913 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888		A0A1W2PQ27	194 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888		A0A1W2PQ64	194 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888		A0A1W2PQD8	194 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	ZNF202	O95125	648 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	CLCN1	P35523	988 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	GNAQ	P50148	359 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	SLC39A14	Q15043	492 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	HS1BP3	Q53T59	392 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	NRDC	O43847	1150 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	MMP1	P03956	469 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	NPR1	P16066	1061 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888		H0YIN7	160 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	TPM3	P06753	285 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	PFKFB1	P16118	471 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	NR5A1	Q13285	461 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	SPECC1	Q5M775	1068 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	HOMER1	Q86YM7	354 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	PNMA1	Q8ND90	353 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LIAS-222	ENST00000640888	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		11.21	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	SMC2	O95347	1197 aa		11.21	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	SOGA3	Q5TF21	947 aa		11.21	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	ORC4	O43929	436 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	RCAN1	P53805	252 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	SLC51A	Q86UW1	340 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	CLIC6	Q96NY7	704 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	CUTA	O60888	179 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	CMA1	P23946	247 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	SCNN1D	P51172	638 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	STK32B	Q9NY57	414 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	HLA-DOA	P06340	250 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	NTRK3	Q16288	839 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888		A0A087WWV3	80 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	USP17L3	A6NCW0	530 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	USP17L4	A6NCW7	530 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	SP8	Q8IXZ3	490 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	POLL	Q9UGP5	575 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	SBK1	Q52WX2	424 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	C12orf60	Q5U649	245 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	COA1	Q9GZY4	146 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	CALML3	P27482	149 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	TXLNA	P40222	546 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	SEC23A	Q15436	765 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	ZNF174	Q15697	407 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	ZNF384	Q8TF68	577 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	MASTL	Q96GX5	879 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	BTAF1	O14981	1849 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	SMTNL1	A8MU46	457 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	BMP15	O95972	392 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	SCG2	P13521	617 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	KLHL34	Q8N239	644 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	USP40	Q9NVE5	1235 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	MARCH6	O60337	910 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	PPP6R2	O75170	966 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LIAS-222	ENST00000640888	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms