RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637015.1

ARID1B-223, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene ARID1B, Length 5,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-223	ENST00000637015	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	ZMYND15	Q9H091	742 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	ZMYM3	Q14202	1370 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	KRT9	P35527	623 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	ARMT1	Q9H993	441 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	PARP2	Q9UGN5	583 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	CSAD	Q9Y600	493 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	MTMR3	Q13615	1198 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	C8orf74	Q6P047	294 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	TRPC6	Q9Y210	931 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	GPAA1	O43292	621 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	CALCRL	Q16602	461 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	CHST3	Q7LGC8	479 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	USP26	Q9BXU7	913 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	CCDC160	A6NGH7	325 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	SLC27A2	O14975	620 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	FAM89A	Q96GI7	184 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015		A0A1W2PP64	1363 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	TXK	P42681	527 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	EXOC3	O60645	756 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	SPATA5	Q8NB90	893 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	GABPA	Q06546	454 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	PPP2R5E	Q16537	467 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	GALNT17	Q6IS24	598 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	PLIN2	Q99541	437 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	PFDN6	O15212	129 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	CLCN1	P35523	988 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	MYCT1	Q8N699	235 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	CUL4B	Q13620	913 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	VCX	Q9H320	206 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	VCX3B	Q9H321	246 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	SEPT6	Q14141	434 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	GCKR	Q14397	625 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	P3H4	Q92791	437 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	ATP2A3	Q93084	1043 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	SMIM23	A6NLE4	172 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015		I3L4J1	428 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	TRIM37	O94972	964 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	HSPA1L	P34931	641 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-223	ENST00000637015	ATP11A	P98196	1134 aa		13.71	□□□□□ -0.22
ARID1B-223	ENST00000637015	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		13.71	□□□□□ -0.22
ARID1B-223	ENST00000637015	CCDC51	Q96ER9	411 aa		13.71	□□□□□ -0.22
ARID1B-223	ENST00000637015	ERO1A	Q96HE7	468 aa		13.71	□□□□□ -0.22
ARID1B-223	ENST00000637015	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
ARID1B-223	ENST00000637015	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-223	ENST00000637015	RXRA	P19793	462 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-223	ENST00000637015	NEDD9	Q14511	834 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-223	ENST00000637015	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-223	ENST00000637015	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-223	ENST00000637015	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-223	ENST00000637015	HAUS1	Q96CS2	278 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-223	ENST00000637015	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-223	ENST00000637015	ATP2B4	P23634	1241 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-223	ENST00000637015	NSMF	Q6X4W1	530 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-223	ENST00000637015	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-223	ENST00000637015	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-223	ENST00000637015	NLRP12	P59046	1061 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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