RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602548.2

CENPVL1-201, Transcript of centromere protein V like 1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CENPVL1, Length 1,620 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPVL1-201ENST00000602548 CCDC17Q96LX7 622 aa28.2■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 PICK1Q9NRD5 415 aa28.2■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP28.2■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 MYH8P13535 1937 aa28.2■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 ASNSP08243 561 aa28.19■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 FGRP09769 529 aa28.19■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 NECTIN1Q15223 517 aa28.19■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 ABCB5Q2M3G0 1257 aa28.19■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 RGMBQ6NW40 437 aa28.19■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 MFSD6Q6ZSS7 791 aa28.19■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 ELP3Q9H9T3 547 aa28.19■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 GINM1Q9NU53 330 aa28.19■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 RASSF10A6NK89 507 aa28.18■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 RASA1P20936 1047 aa28.18■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 CABP5Q9NP86 173 aa28.18■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 TOMM22Q9NS69 142 aa28.18■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa28.18■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 HTRA3P83110 453 aa28.18■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 RNF20Q5VTR2 975 aa28.18■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 INCENPQ9NQS7 918 aa28.18■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 TACC3Q9Y6A5 838 aa28.18■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 DOCK1Q14185 1865 aa28.17■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 SLC27A2O14975 620 aa28.17■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 ORC4O43929 436 aa28.17■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 GH2P01242 217 aa28.17■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 JAG1P78504 1218 aa28.17■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 DEFB115Q30KQ5 88 aa28.17■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 CREB3L3Q68CJ9 461 aa28.17■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 AKR1B1P15121 316 aa28.16■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 ERO1BQ86YB8 467 aa28.16■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 SPDYE5A6NIY4 337 aa28.15■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 TMEM179Q6ZVK1 233 aa28.15■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 USP26Q9BXU7 913 aa28.15■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 ATAD5Q96QE3 1844 aa28.15■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 NEDD4P46934 1319 aa28.15■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 PTPRAP18433 802 aa28.14■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 OPTNQ96CV9 577 aa28.14■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
CENPVL1-201ENST00000602548 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 RAB3GAP1Q15042 981 aa28.14■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 CCDC102AQ96A19 550 aa28.14■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 CNNM2Q9H8M5 875 aa28.14■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 TAF6LQ9Y6J9 622 aa28.14■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 SEC24BO95487 1268 aa28.13■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 TSPY3P0CV98 308 aa28.13■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 TSPY8P0CW00 308 aa28.13■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 HSPA4P34932 840 aa28.13■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 PPATQ06203 517 aa28.13■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 RASAL3Q86YV0 1011 aa28.13■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa28.13■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 OTUD5Q96G74 571 aa28.13■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 ZHX2Q9Y6X8 837 aa28.13■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 TSPY2A6NKD2 308 aa28.12■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 USP17L5A8MUK1 530 aa28.12■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 E7EWF7 191 aa28.12■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 NT5C2P49902 561 aa28.12■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 TRDNQ13061 729 aa28.12■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 FAM47AQ5JRC9 791 aa28.12■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 ESR2Q92731 530 aa28.12■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 KRT23Q9C075 422 aa28.12■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 SLC10A3P09131 477 aa28.11■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 TFAP4Q01664 338 aa28.11■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 SEPT2Q15019 361 aa28.11■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 CYP4F22Q6NT55 531 aa28.11■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 WNK4Q96J92 1243 aa28.11■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 MCCP23508 829 aa28.1■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 SPRYD7Q5W111 196 aa28.1■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 NEDD1Q8NHV4 660 aa28.1■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 TBC1D2Q9BYX2 928 aa28.1■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 PLIN4Q96Q06 1357 aa28.1■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 B4E1Z4 1266 aa28.1■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 GUCY1A2P33402 732 aa28.1■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 ECE1P42892 770 aa28.1■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 GRM1Q13255 1194 aa28.1■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 PPIL2Q13356 520 aa28.1■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 STOX1Q6ZVD7 989 aa28.1■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 CAPNS2Q96L46 248 aa28.1■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP28.1■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 AS3MTQ9HBK9 375 aa28.1■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 NCOA7Q8NI08 942 aa28.09■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 IRF6O14896 467 aa28.08■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 KDM4AO75164 1064 aa28.08■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 GJA5P36382 358 aa28.08■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 TSGA10IPQ3SY00 556 aa28.08■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 RASEFQ8IZ41 740 aa28.08■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 KANSL2Q9H9L4 492 aa28.08■■■□□ 2.09
CENPVL1-201ENST00000602548 ICA1Q05084 483 aa28.07■■■□□ 2.08
CENPVL1-201ENST00000602548 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
CENPVL1-201ENST00000602548 ZNF280CQ8ND82 737 aa28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.5 ms