RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADM5	C9JUS6	153 aa		10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	FGD1	P98174	961 aa		10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q6ZUG5	572 aa		10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		10.79	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	NMT2	O60551	498 aa		10.79	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	TSPY3	P0CV98	308 aa		10.79	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	TSPY8	P0CW00	308 aa		10.79	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		10.79	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		10.79	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		10.79	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		10.79	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	AKR1B1	P15121	316 aa		10.79	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	IQCA1	Q86XH1	822 aa		10.79	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		10.79	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	BRF1	Q92994	677 aa		10.79	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	SNX21	Q969T3	373 aa		10.79	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		10.79	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	TBC1D12	O60347	775 aa		10.78	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAP3K10	Q02779	954 aa		10.78	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		10.78	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	USP48	Q86UV5	1035 aa		10.78	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		10.78	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		10.78	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	TNKS	O95271	1327 aa		10.78	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM87B	Q96K49	555 aa		10.78	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		10.78	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	SENP2	Q9HC62	589 aa		10.78	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	GDF11	O95390	407 aa		10.77	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	NT5C2	P49902	561 aa		10.77	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	FBXL16	Q8N461	479 aa		10.77	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	IL27	Q8NEV9	243 aa		10.77	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		10.77	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	10.77	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	FZD1	Q9UP38	647 aa		10.77	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANKRD1	Q15327	319 aa		10.77	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	HSCB	Q8IWL3	235 aa		10.77	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC17	Q96LX7	622 aa		10.77	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	LY9	Q9HBG7	655 aa		10.77	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	ERICH2	A1L162	156 aa		10.77	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	APOBR	Q0VD83	1088 aa		10.77	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	SEC23A	Q15436	765 aa		10.77	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		10.77	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		10.77	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		10.77	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYH8	P13535	1937 aa		10.76	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	MCM2	P49736	904 aa		10.76	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	JAG1	P78504	1218 aa		10.76	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		10.76	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	CEP95	Q96GE4	821 aa		10.76	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	MTA3	Q9BTC8	594 aa		10.76	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		10.76	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		10.76	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		10.76	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	LIFR	P42702	1097 aa		10.76	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	WTAP	Q15007	396 aa		10.76	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		10.76	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	DCAF15	Q66K64	600 aa		10.76	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		10.76	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	LDHD	Q86WU2	507 aa		10.76	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	HOOK2	Q96ED9	719 aa		10.76	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	STX8	Q9UNK0	236 aa		10.76	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	GH2	P01242	217 aa		10.76	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC4A3	P48751	1232 aa		10.76	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRKG1	Q13976	671 aa		10.76	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDCA5	Q96FF9	252 aa		10.76	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMX3	Q96JJ7	454 aa		10.76	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		10.76	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		10.76	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		10.75	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	LARGE1	O95461	756 aa		10.75	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	BECN1	Q14457	450 aa		10.75	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		10.75	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		10.75	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		10.75	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		10.75	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRAF5	O00463	557 aa		10.75	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	CAP2	P40123	477 aa		10.75	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	SEPT2	Q15019	361 aa		10.75	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		10.75	□□□□□ -0.69
EFTUD2-223	ENST00000592576	ME3	Q16798	604 aa		10.75	□□□□□ -0.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms