RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556067.1

ATL1-208, Transcript of atlastin GTPase 1, human

TSL 4

Gene ATL1, Length 550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATL1-208	ENST00000556067	ABCC12	Q96J65	1359 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF609	O15014	1411 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	GOLIM4	O00461	696 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	TAF5L	O75529	589 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	MMP10	P09238	476 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	ALDH1B1	P30837	517 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	USP4	Q13107	963 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	UBE4A	Q14139	1066 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	RAD50	Q92878	1312 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067		H0YIN7	160 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	TRAK2	O60296	914 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	WFS1	O76024	890 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	NPR1	P16066	1061 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	ADORA1	P30542	326 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	DDR1	Q08345	913 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	CCDC102B	Q68D86	513 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	MSL1	Q68DK7	614 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	RNF217	Q8TC41	542 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	GLMN	Q92990	594 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067		A6NJR5	290 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	SGSM2	O43147	1006 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	RHOQ	P17081	205 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	FGFR2	P21802	821 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	ATP2B4	P23634	1241 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	POLD1	P28340	1107 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	PTS	Q03393	145 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	MAP3K12	Q12852	859 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	RABEP1	Q15276	862 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	EML3	Q32P44	896 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	CRY2	Q49AN0	593 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	HSCB	Q8IWL3	235 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	SPATA5	Q8NB90	893 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	6.65	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	MASTL	Q96GX5	879 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	USP26	Q9BXU7	913 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		6.65	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	XDH	P47989	1333 aa		6.65	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	MYH3	P11055	1940 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	GNRH1	P01148	92 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	ZAP70	P43403	619 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	PHKA1	P46020	1223 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	ANAPC15	P60006	121 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	TREML4	Q6UXN2	200 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	SP8	Q8IXZ3	490 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	CNKSR1	Q969H4	720 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	GGA1	Q9UJY5	639 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	C4A	P0C0L4	1744 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	LAMB2	P55268	1798 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	USP17L5	A8MUK1	530 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	IGSF3	O75054	1194 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ATL1-208	ENST00000556067	CLN3	Q13286	438 aa		6.63	□□□□□ -1.35

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