RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546471.5

RRN3P1-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RRN3P1, Length 2,608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-202ENST00000546471 KARSQ15046 597 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 DNAJC10Q8IXB1 793 aa10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 TMTC2Q8N394 836 aa10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 MAGEB6Q8N7X4 407 aa10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 SPATA5Q8NB90 893 aa10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 LPIN2Q92539 896 aa10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 DHX58Q96C10 678 aa10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 UBXN6Q9BZV1 441 aa10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 EPC1Q9H2F5 836 aa10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 OAS2P29728 719 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 TXLNAP40222 546 aa10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 TDO2P48775 406 aa10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 RCAN1P53805 252 aa10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 GPS2Q13227 327 aa10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 TXLNBQ8N3L3 684 aa10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 SPATA20Q8TB22 786 aa10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 STAG1Q8WVM7 1258 aa10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 PARD6BQ9BYG5 372 aa10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 CSRNP2Q9H175 543 aa10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 ARMT1Q9H993 441 aa10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 KIF5CO60282 957 aa10.73□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 SASH3O75995 380 aa10.73□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 GNAT2P19087 354 aa10.73□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 NR5A1Q13285 461 aa10.73□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 CTAGE1Q96RT6 745 aa10.73□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 MTA3Q9BTC8 594 aa10.73□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 MROH5Q6ZUA9 1318 aa10.73□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa10.73□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 SOWAHDA6NJG2 315 aa10.73□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 PDE8AO60658 829 aa10.73□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 SLC5A1P13866 664 aa10.73□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 XBP1P17861 261 aa10.73□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 ATP2B1P20020 1258 aa10.73□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 HLFQ16534 295 aa10.73□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 SPATA1Q5VX52 437 aa10.73□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 CCDC82Q8N4S0 544 aa10.73□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 IGSF22Q8N9C0 903 aa10.73□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa10.73□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 CARD10Q9BWT7 1032 aa10.73□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 CCDC151A5D8V7 595 aa10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 GSG1L2A8MUP6 293 aa10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 CHMP4BP1P59074 171 aa10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 MTF1Q14872 753 aa10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 BRD3Q15059 726 aa10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 FILIP1LQ4L180 1135 aa10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 MED15Q96RN5 788 aa10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 CABP5Q9NP86 173 aa10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 LZTFL1Q9NQ48 299 aa10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 STRN4Q9NRL3 753 aa10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 TRIM75PA6NK02 468 aa10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 POTEB2H3BUK9 544 aa10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 TUBB2AQ13885 445 aa10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF654Q8IZM8 581 aa10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 CEP112Q8N8E3 955 aa10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 FANCBQ8NB91 859 aa10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 NUP133Q8WUM0 1156 aa10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 UBAC1Q9BSL1 405 aa10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 TUBB2BQ9BVA1 445 aa10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 ADGRG1Q9Y653 693 aa10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 TACC3Q9Y6A5 838 aa10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 CHD4Q14839 1912 aa10.72□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 SEMA3EO15041 775 aa10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 FGFR2P21802 821 aa10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 TUBB4BP68371 445 aa10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 RBL2Q08999 1139 aa10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 RASGRF1Q13972 1273 aa10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 KLHL10Q6JEL2 608 aa10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 USP49Q70CQ1 688 aa10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 OXER1Q8TDS5 423 aa10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 FUT8Q9BYC5 575 aa10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 RTL9Q8NET4 1388 aa10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 TEX33O43247 280 aa10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 BMP15O95972 392 aa10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 TRHP20396 242 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 PPP2R5BQ15173 497 aa10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 LONRF2Q1L5Z9 754 aa10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 CNGA4Q8IV77 575 aa10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 CCDC51Q96ER9 411 aa10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 SEC31BQ9NQW1 1179 aa10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 ASAP1Q9ULH1 1129 aa10.71□□□□□ -0.69
RRN3P1-202ENST00000546471 MYH3P11055 1940 aa10.71□□□□□ -0.7
RRN3P1-202ENST00000546471 ARAP2Q8WZ64 1704 aa10.71□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms