RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 HSPA4P34932 840 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 SMC6Q96SB8 1091 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 TRIM7Q9C029 511 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 SEMA3EO15041 775 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 BIRC3Q13489 604 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 CCT6BQ92526 530 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 ANAPC4Q9UJX5 808 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 DAPK3O43293 454 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 HSPA2P54652 639 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 ARID5AQ03989 594 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 MLKLQ8NB16 471 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 CARD14Q9BXL6 1004 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 ZRANB1Q9UGI0 708 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 TSKSQ9UJT2 592 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 TNFAIP3P21580 790 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 PTGS1P23219 599 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 FAM160A1Q05DH4 1040 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 PDE4DQ08499 809 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 CALCOCO2Q13137 446 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 ANO1Q5XXA6 986 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 CHST3Q7LGC8 479 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC114Q96M63 670 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 ARMT1Q9H993 441 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 LEMD3Q9Y2U8 911 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 NEURL1BA8MQ27 555 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 ZBTB16Q05516 673 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 INF2Q27J81 1249 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 TTC38Q5R3I4 469 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 ARHGEF16Q5VV41 709 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 FAM196AQ6ZSG2 479 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC110Q8TBZ0 833 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 WDR17Q8IZU2 1322 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 MED23Q9ULK4 1368 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 PHACTR3Q96KR7 559 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 CTNND2Q9UQB3 1225 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 VIMP08670 466 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 ATP5JP18859 108 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 RPS8P62241 208 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 RNF34Q969K3 372 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 PAK1Q13153 545 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 TAOK1Q7L7X3 1001 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 NLGN1Q8N2Q7 840 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 AATKQ6ZMQ8 1374 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 GIPC1O14908 333 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 MXRA7P84157 204 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 NACA2Q9H009 215 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 FAM204AQ9H8W3 233 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 ERICH4A6NGS2 130 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 GCNT3O95395 438 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 TIMM10P62072 90 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 CFAP157Q5JU67 520 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF532Q9HCE3 1301 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 TMOD1P28289 359 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF174Q15697 407 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 PPP2R5EQ16537 467 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 SMC1BQ8NDV3 1235 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 FBF1Q8TES7 1133 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 TMX1Q9H3N1 280 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 FAM184BQ9ULE4 1060 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 ERVK-7P63135 1459 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 RAPGEF1Q13905 1077 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 FAM81BQ96LP2 452 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 DNAJC25Q9H1X3 360 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 ITIH3Q06033 890 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-226ENST00000546160 SULF1Q8IWU6 871 aa7.12□□□□□ -1.27
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