RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537143.5

ATG16L2-208, Transcript of autophagy related 16 like 2, human

TSL 2

Gene ATG16L2, Length 519 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG16L2-208	ENST00000537143	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		27.71	■■■□□ 2.03
ATG16L2-208	ENST00000537143	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
ATG16L2-208	ENST00000537143	CERS3	Q8IU89	383 aa		27.71	■■■□□ 2.03
ATG16L2-208	ENST00000537143	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		27.71	■■■□□ 2.03
ATG16L2-208	ENST00000537143	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
ATG16L2-208	ENST00000537143	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
ATG16L2-208	ENST00000537143	EHD4	Q9H223	541 aa		27.71	■■■□□ 2.03
ATG16L2-208	ENST00000537143	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		27.7	■■■□□ 2.03
ATG16L2-208	ENST00000537143	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		27.7	■■■□□ 2.03
ATG16L2-208	ENST00000537143	HLA-DOA	P06340	250 aa		27.7	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	ATP5J	P18859	108 aa		27.7	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	USP5	P45974	858 aa		27.7	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	PLCD1	P51178	756 aa		27.7	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	SHISA4	Q96DD7	197 aa		27.7	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	HOXD10	P28358	340 aa		27.69	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	GRK4	P32298	578 aa		27.69	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		27.69	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		27.69	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	BCL11A	Q9H165	835 aa		27.69	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		27.69	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		27.69	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		27.68	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	GH2	P01242	217 aa		27.68	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	SHMT1	P34896	483 aa		27.68	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		27.68	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	LCORL	Q8N3X6	602 aa		27.68	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	RAET1E	Q8TD07	263 aa		27.68	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	GINM1	Q9NU53	330 aa		27.68	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	PEX10	O60683	326 aa		27.67	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	FLT3LG	P49771	235 aa		27.67	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	GABPA	Q06546	454 aa		27.67	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	HAUS7	Q99871	368 aa		27.67	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		27.67	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		27.67	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		27.67	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	PNMA3	Q9UL41	463 aa		27.67	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		27.67	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	GUCY1A2	P33402	732 aa		27.65	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	ADD2	P35612	726 aa		27.65	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		27.65	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		27.65	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	PLXNB2	O15031	1838 aa		27.64	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	USP17L10	C9JJH3	530 aa		27.64	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		27.64	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		27.64	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		27.64	■■■□□ 2.02
ATG16L2-208	ENST00000537143	C19orf81	C9J6K1	198 aa		27.63	■■■□□ 2.01
ATG16L2-208	ENST00000537143	SMIM22	K7EJ46	135 aa		27.63	■■■□□ 2.01
ATG16L2-208	ENST00000537143	CYP2D6	P10635	497 aa		27.63	■■■□□ 2.01
ATG16L2-208	ENST00000537143	ELN	P15502	786 aa		27.63	■■■□□ 2.01
ATG16L2-208	ENST00000537143	IRF5	Q13568	498 aa		27.63	■■■□□ 2.01
ATG16L2-208	ENST00000537143	TTC6	Q86TZ1	520 aa		27.63	■■■□□ 2.01
ATG16L2-208	ENST00000537143	ARMT1	Q9H993	441 aa		27.63	■■■□□ 2.01
ATG16L2-208	ENST00000537143	PRKAB2	O43741	272 aa		27.62	■■■□□ 2.01
ATG16L2-208	ENST00000537143	ADCY3	O60266	1144 aa		27.62	■■■□□ 2.01
ATG16L2-208	ENST00000537143	CCL5	P13501	91 aa		27.62	■■■□□ 2.01
ATG16L2-208	ENST00000537143	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	27.62	■■■□□ 2.01
ATG16L2-208	ENST00000537143	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		27.62	■■■□□ 2.01
ATG16L2-208	ENST00000537143	ACER1	Q8TDN7	264 aa		27.62	■■■□□ 2.01
ATG16L2-208	ENST00000537143	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
ATG16L2-208	ENST00000537143	DCTPP1	Q9H773	170 aa		27.62	■■■□□ 2.01
ATG16L2-208	ENST00000537143	GJD2	Q9UKL4	321 aa		27.62	■■■□□ 2.01
ATG16L2-208	ENST00000537143	SLC34A2	O95436	690 aa		27.61	■■■□□ 2.01
ATG16L2-208	ENST00000537143	C12orf42	Q96LP6	360 aa		27.61	■■■□□ 2.01
ATG16L2-208	ENST00000537143	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		27.61	■■■□□ 2.01
ATG16L2-208	ENST00000537143	HERVK_113	P62684	666 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ATG16L2-208	ENST00000537143	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
ATG16L2-208	ENST00000537143	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ATG16L2-208	ENST00000537143	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ATG16L2-208	ENST00000537143	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ATG16L2-208	ENST00000537143	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ATG16L2-208	ENST00000537143	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ATG16L2-208	ENST00000537143	MYH7	P12883	1935 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ATG16L2-208	ENST00000537143	MBD4	O95243	580 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ATG16L2-208	ENST00000537143	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ATG16L2-208	ENST00000537143	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ATG16L2-208	ENST00000537143	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ATG16L2-208	ENST00000537143	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
ATG16L2-208	ENST00000537143	GJB1	P08034	283 aa		27.58	■■■□□ 2.01
ATG16L2-208	ENST00000537143	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
ATG16L2-208	ENST00000537143	INHA	P05111	366 aa		27.57	■■■□□ 2
ATG16L2-208	ENST00000537143	GJA8	P48165	433 aa		27.57	■■■□□ 2
ATG16L2-208	ENST00000537143		Q3C1V9	767 aa		27.57	■■■□□ 2
ATG16L2-208	ENST00000537143	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		27.57	■■■□□ 2
ATG16L2-208	ENST00000537143	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		27.57	■■■□□ 2
ATG16L2-208	ENST00000537143	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		27.57	■■■□□ 2
ATG16L2-208	ENST00000537143	SEPT2	Q15019	361 aa		27.56	■■■□□ 2
ATG16L2-208	ENST00000537143	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		27.56	■■■□□ 2
ATG16L2-208	ENST00000537143	UBE3C	Q15386	1083 aa		27.56	■■■□□ 2
ATG16L2-208	ENST00000537143	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
ATG16L2-208	ENST00000537143	COA7	Q96BR5	231 aa		27.56	■■■□□ 2
ATG16L2-208	ENST00000537143	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		27.56	■■■□□ 2
ATG16L2-208	ENST00000537143	RNF208	Q9H0X6	261 aa		27.56	■■■□□ 2

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