RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533897.1

CTSC-208, Transcript of cathepsin C, human

TSL 2

Gene CTSC, Length 4,344 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-208	ENST00000533897	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	BIN1	O00499	593 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	5.08	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	PLCD1	P51178	756 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	5.08	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	POSTN	Q15063	836 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	ARID3A	Q99856	593 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	XDH	P47989	1333 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	BTAF1	O14981	1849 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	RASSF10	A6NK89	507 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	ABL1	P00519	1130 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	IQUB	Q8NA54	791 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	MLKL	Q8NB16	471 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	LRRC15	Q8TF66	581 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	5.08	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	BECN2	A8MW95	431 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	BTBD18	B2RXH4	712 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	CAPN2	P17655	700 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	UBASH3A	P57075	661 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	MTF1	Q14872	753 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	PTPN21	Q16825	1174 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	FAM205C	A6NFA0	338 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	GYPC	P04921	128 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	LCORL	Q8N3X6	602 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	SPATA5	Q8NB90	893 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	LPIN2	Q92539	896 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	SDF4	Q9BRK5	362 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897		H3BQF6	201 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	TEX33	O43247	280 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	ZBTB43	O43298	467 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	IGSF3	O75054	1194 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	RPS6KA5	O75582	802 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	CDKL5	O76039	1030 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	RXRA	P19793	462 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	TROAP	Q12815	778 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	MYL10	Q9BUA6	226 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	TMEM51	Q9NW97	253 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	PRKAB2	O43741	272 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	PDE8A	O60658	829 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	NTSR2	O95665	410 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	ERVK-24	P63145	666 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	NR5A1	Q13285	461 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	RABGGTA	Q92696	567 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	PAGE5	Q96GU1	130 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	CSRNP2	Q9H175	543 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	EPC1	Q9H2F5	836 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	CCP110	O43303	1012 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	CBFA2T2	O43439	604 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	SMC2	O95347	1197 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTSC-208	ENST00000533897	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		5.06	□□□□□ -1.6

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