RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520903.1

RNF19A-208, Transcript of ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 2

Gene RNF19A, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF19A-208	ENST00000520903	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	KDR	P35968	1356 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	MMP20	O60882	483 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	SASH3	O75995	380 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	CTSH	P09668	335 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	GNA15	P30679	374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	MTHFS	P49914	203 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	CCIN	Q13939	588 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	SYT17	Q9BSW7	474 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	BACH2	Q9BYV9	841 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	RRAGC	Q9HB90	399 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	ATG3	Q9NT62	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	MAP3K5	Q99683	1374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	ITGB4	P16144	1822 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RNF19A-208	ENST00000520903	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	PHACTR2	O75167	634 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	CD33	P20138	364 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	SIK1	P57059	783 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	ATP2B2	Q01814	1243 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	ITPK1	Q13572	414 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	OR13H1	Q8NG92	308 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	NPHS2	Q9NP85	383 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	MARK1	Q9P0L2	795 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	PALLD	Q8WX93	1383 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	C2CD2L	O14523	706 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	KIF4A	O95239	1232 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	MAP3K6	O95382	1288 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	NEFL	P07196	543 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	BMP4	P12644	408 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	TCF3	P15923	654 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	NFKB1	P19838	968 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	AMPD1	P23109	780 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	FGD1	P98174	961 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	CTBS	Q01459	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	SPEM2	Q0P670	501 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	SMIM5	Q71RC9	77 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	LGR6	Q9HBX8	967 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	AK5	Q9Y6K8	562 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	SORBS3	O60504	671 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	PROC	P04070	461 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	ITGB2	P05107	769 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	ACPP	P15309	386 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	FGFR3	P22607	806 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	SOX18	P35713	384 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	PSMD2	Q13200	908 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	TTC16	Q8NEE8	873 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	FRMD6	Q96NE9	622 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF19A-208	ENST00000520903	MDFI	Q99750	246 aa		4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms