RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509638.5

LIMCH1-211, Transcript of LIM and calponin homology domains 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMCH1, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMCH1-211ENST00000509638 NECTIN1Q15223 517 aa35.13■■■■□ 3.21
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LIMCH1-211ENST00000509638 TAF6LQ9Y6J9 622 aa35.13■■■■□ 3.21
LIMCH1-211ENST00000509638 CREB3L3Q68CJ9 461 aa35.12■■■■□ 3.21
LIMCH1-211ENST00000509638 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
LIMCH1-211ENST00000509638 ELP3Q9H9T3 547 aa35.12■■■■□ 3.21
LIMCH1-211ENST00000509638 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
LIMCH1-211ENST00000509638 NEDD4P46934 1319 aa35.12■■■■□ 3.21
LIMCH1-211ENST00000509638 UNCXA6NJT0 531 aa35.11■■■■□ 3.21
LIMCH1-211ENST00000509638 SLC27A2O14975 620 aa35.11■■■■□ 3.21
LIMCH1-211ENST00000509638 SEC24BO95487 1268 aa35.11■■■■□ 3.21
LIMCH1-211ENST00000509638 MFSD6Q6ZSS7 791 aa35.11■■■■□ 3.21
LIMCH1-211ENST00000509638 TOMM22Q9NS69 142 aa35.11■■■■□ 3.21
LIMCH1-211ENST00000509638 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa35.11■■■■□ 3.21
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LIMCH1-211ENST00000509638 HSPA6P17066 643 aa35.1■■■■□ 3.21
LIMCH1-211ENST00000509638 JAG1P78504 1218 aa35.1■■■■□ 3.21
LIMCH1-211ENST00000509638 ABCB5Q2M3G0 1257 aa35.1■■■■□ 3.21
LIMCH1-211ENST00000509638 PICK1Q9NRD5 415 aa35.1■■■■□ 3.21
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LIMCH1-211ENST00000509638 ORC4O43929 436 aa35.09■■■■□ 3.21
LIMCH1-211ENST00000509638 GH2P01242 217 aa35.09■■■■□ 3.21
LIMCH1-211ENST00000509638 FGRP09769 529 aa35.09■■■■□ 3.21
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LIMCH1-211ENST00000509638 AKR1B1P15121 316 aa35.09■■■■□ 3.21
LIMCH1-211ENST00000509638 HTRA3P83110 453 aa35.09■■■■□ 3.21
LIMCH1-211ENST00000509638 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
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LIMCH1-211ENST00000509638 CCDC17Q96LX7 622 aa35.08■■■■□ 3.21
LIMCH1-211ENST00000509638 USP26Q9BXU7 913 aa35.08■■■■□ 3.21
LIMCH1-211ENST00000509638 CEP350Q5VT06 3117 aa35.08■■■■□ 3.21
LIMCH1-211ENST00000509638 ASNSP08243 561 aa35.08■■■■□ 3.21
LIMCH1-211ENST00000509638 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.2
LIMCH1-211ENST00000509638 HHIPL1Q96JK4 782 aa35.07■■■■□ 3.2
LIMCH1-211ENST00000509638 HSPA4P34932 840 aa35.06■■■■□ 3.2
LIMCH1-211ENST00000509638 RGMBQ6NW40 437 aa35.06■■■■□ 3.2
LIMCH1-211ENST00000509638 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa35.06■■■■□ 3.2
LIMCH1-211ENST00000509638 SLC10A4Q96EP9 437 aa35.06■■■■□ 3.2
LIMCH1-211ENST00000509638 CABP5Q9NP86 173 aa35.06■■■■□ 3.2
LIMCH1-211ENST00000509638 RASSF10A6NK89 507 aa35.05■■■■□ 3.2
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LIMCH1-211ENST00000509638 STOX1Q6ZVD7 989 aa35.05■■■■□ 3.2
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LIMCH1-211ENST00000509638 PLIN4Q96Q06 1357 aa35.05■■■■□ 3.2
LIMCH1-211ENST00000509638 SPDYE5A6NIY4 337 aa35.04■■■■□ 3.2
LIMCH1-211ENST00000509638 E7EWF7 191 aa35.04■■■■□ 3.2
LIMCH1-211ENST00000509638 PTPRAP18433 802 aa35.04■■■■□ 3.2
LIMCH1-211ENST00000509638 RAB3GAP1Q15042 981 aa35.04■■■■□ 3.2
LIMCH1-211ENST00000509638 FAM47AQ5JRC9 791 aa35.04■■■■□ 3.2
LIMCH1-211ENST00000509638 TMEM179Q6ZVK1 233 aa35.04■■■■□ 3.2
LIMCH1-211ENST00000509638 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
LIMCH1-211ENST00000509638 GINM1Q9NU53 330 aa35.04■■■■□ 3.2
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LIMCH1-211ENST00000509638 TSPY3P0CV98 308 aa35.04■■■■□ 3.2
LIMCH1-211ENST00000509638 TSPY8P0CW00 308 aa35.04■■■■□ 3.2
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LIMCH1-211ENST00000509638 RASAL3Q86YV0 1011 aa35.04■■■■□ 3.2
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LIMCH1-211ENST00000509638 OTUD5Q96G74 571 aa35.04■■■■□ 3.2
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LIMCH1-211ENST00000509638 MCCP23508 829 aa35.02■■■■□ 3.2
LIMCH1-211ENST00000509638 GUCY1A2P33402 732 aa35.02■■■■□ 3.2
LIMCH1-211ENST00000509638 TFAP4Q01664 338 aa35.02■■■■□ 3.2
LIMCH1-211ENST00000509638 SEPT2Q15019 361 aa35.02■■■■□ 3.2
LIMCH1-211ENST00000509638 CLEC10AQ8IUN9 316 aa35.02■■■■□ 3.2
LIMCH1-211ENST00000509638 RASEFQ8IZ41 740 aa35.02■■■■□ 3.2
LIMCH1-211ENST00000509638 NKX2-3Q8TAU0 364 aa35.02■■■■□ 3.2
LIMCH1-211ENST00000509638 ESR2Q92731 530 aa35.02■■■■□ 3.2
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LIMCH1-211ENST00000509638 USP17L5A8MUK1 530 aa35■■■■□ 3.19
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LIMCH1-211ENST00000509638 SLC10A3P09131 477 aa35■■■■□ 3.19
LIMCH1-211ENST00000509638 CYP4F22Q6NT55 531 aa35■■■■□ 3.19
LIMCH1-211ENST00000509638 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
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LIMCH1-211ENST00000509638 SNX14Q9Y5W7 946 aa34.98■■■■□ 3.19
LIMCH1-211ENST00000509638 NT5C2P49902 561 aa34.97■■■■□ 3.19
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LIMCH1-211ENST00000509638 PCNTO95613 3336 aa34.97■■■■□ 3.19
LIMCH1-211ENST00000509638 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
LIMCH1-211ENST00000509638 TSGA10IPQ3SY00 556 aa34.96■■■■□ 3.19
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