RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 PDE1AP54750 535 aa25.32■■□□□ 1.64
SH3BP2-210ENST00000505941 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
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SH3BP2-210ENST00000505941 CHD1LQ86WJ1 897 aa25.32■■□□□ 1.64
SH3BP2-210ENST00000505941 SWAP70Q9UH65 585 aa25.32■■□□□ 1.64
SH3BP2-210ENST00000505941 GNAT2P19087 354 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP2-210ENST00000505941 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.64
SH3BP2-210ENST00000505941 EVI5LQ96CN4 794 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP2-210ENST00000505941 WDR18Q9BV38 432 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP2-210ENST00000505941 TMOD4Q9NZQ9 345 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP2-210ENST00000505941 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
SH3BP2-210ENST00000505941 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa25.31■■□□□ 1.64
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SH3BP2-210ENST00000505941 MOGSQ13724 837 aa25.3■■□□□ 1.64
SH3BP2-210ENST00000505941 ABCB5Q2M3G0 1257 aa25.3■■□□□ 1.64
SH3BP2-210ENST00000505941 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
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SH3BP2-210ENST00000505941 PNMA3Q9UL41 463 aa25.3■■□□□ 1.64
SH3BP2-210ENST00000505941 TRIM17Q9Y577 477 aa25.3■■□□□ 1.64
SH3BP2-210ENST00000505941 C19orf81C9J6K1 198 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP2-210ENST00000505941 GH2P01242 217 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP2-210ENST00000505941 APPP05067 770 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP2-210ENST00000505941 GPAT2Q6NUI2 795 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP2-210ENST00000505941 CD99L2Q8TCZ2 262 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP2-210ENST00000505941 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP2-210ENST00000505941 SALL3Q9BXA9 1300 aa25.29■■□□□ 1.64
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SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC85CA6NKD9 419 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP2-210ENST00000505941 USP17L12C9JPN9 530 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP2-210ENST00000505941 USP17L21D6R901 530 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP2-210ENST00000505941 HMGCS2P54868 508 aa25.28■■□□□ 1.64
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SH3BP2-210ENST00000505941 EFCC1Q9HA90 598 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP2-210ENST00000505941 ATAD5Q96QE3 1844 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP2-210ENST00000505941 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP2-210ENST00000505941 USP17L10C9JJH3 530 aa25.27■■□□□ 1.64
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SH3BP2-210ENST00000505941 GPAA1O43292 621 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP2-210ENST00000505941 OSBPP22059 807 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP2-210ENST00000505941 BACE1P56817 501 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP2-210ENST00000505941 C12orf60Q5U649 245 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP2-210ENST00000505941 NACAP1Q9BZK3 213 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP2-210ENST00000505941 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
SH3BP2-210ENST00000505941 SIPA1L1O43166 1804 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP2-210ENST00000505941 SHMT1P34896 483 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP2-210ENST00000505941 MTMR2Q13614 643 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP2-210ENST00000505941 SH3D19Q5HYK7 790 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP2-210ENST00000505941 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
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SH3BP2-210ENST00000505941 GABPAQ06546 454 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP2-210ENST00000505941 C17orf99Q6UX52 265 aa25.25■■□□□ 1.63
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SH3BP2-210ENST00000505941 TDO2P48775 406 aa25.24■■□□□ 1.63
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SH3BP2-210ENST00000505941 CTR9Q6PD62 1173 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP2-210ENST00000505941 OTOP1Q7RTM1 612 aa25.24■■□□□ 1.63
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SH3BP2-210ENST00000505941 USP14P54578 494 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-210ENST00000505941 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-210ENST00000505941 USP17L2Q6R6M4 530 aa25.23■■□□□ 1.63
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SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC17Q96LX7 622 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-210ENST00000505941 GSG1L2A8MUP6 293 aa25.22■■□□□ 1.63
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SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF287Q9HBT7 754 aa25.22■■□□□ 1.63
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SH3BP2-210ENST00000505941 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SH3BP2-210ENST00000505941 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SH3BP2-210ENST00000505941 SBK1Q52WX2 424 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM179Q6ZVK1 233 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP2-210ENST00000505941 OSBPL3Q9H4L5 887 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP2-210ENST00000505941 MKNK2Q9HBH9 465 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP2-210ENST00000505941 HPS5Q9UPZ3 1129 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP2-210ENST00000505941 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 C16orf86Q6ZW13 317 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 HELLSQ9NRZ9 838 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 PTPN22Q9Y2R2 807 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 PSMC4P43686 418 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP2-210ENST00000505941 SEPT2Q15019 361 aa25.19■■□□□ 1.62
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