RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498694.1

CTPS1-212, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 599 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-212ENST00000498694 NOS2P35228 1153 aa5.08□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 NEXNQ0ZGT2 675 aa5.08□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 TEAD4Q15561 434 aa5.08□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 CRY2Q49AN0 593 aa5.08□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa5.08□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 SUSD4Q5VX71 490 aa5.08□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 NLGN1Q8N2Q7 840 aa5.08□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 CNBD1Q8NA66 436 aa5.08□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 PANK1Q8TE04 598 aa5.08□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 VTI1AQ96AJ9 217 aa5.08□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 PLA2G12BQ9BX93 195 aa5.08□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa5.08□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 TIAM2Q8IVF5 1701 aa5.08□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 ZNF609O15014 1411 aa5.07□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 UTRNP46939 3433 aa5.07□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 H7C1W4 665 aa5.07□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 F11P03951 625 aa5.07□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 IGFBP4P22692 258 aa5.07□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 ITGA6P23229 1130 aa5.07□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 TXLNAP40222 546 aa5.07□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 CTSWP56202 376 aa5.07□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 MTX1Q13505 466 aa5.07□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 SLC4A10Q6U841 1118 aa5.07□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 BICDL1Q6ZP65 573 aa5.07□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 ITPRIPQ8IWB1 547 aa5.07□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa5.07□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 PGBD3Q8N328 593 aa5.07□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 ANKRD44Q8N8A2 993 aa5.07□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 KAZALD1Q96I82 304 aa5.07□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 SUCLG2Q96I99 432 aa5.07□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 NYXQ9GZU5 481 aa5.07□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 RUBCNLQ9H714 662 aa5.07□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 DDX19BQ9UMR2 479 aa5.07□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 TAF1P21675 1872 aa5.07□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa5.07□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 TMEM88BA6NKF7 163 aa5.06□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 EML1O00423 815 aa5.06□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 TERTO14746 1132 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 SERPINB2P05120 415 aa5.06□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 ATP2B4P23634 1241 aa5.06□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 WEE1P30291 646 aa5.06□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 ST5P78524 1137 aa5.06□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa5.06□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa5.06□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 CRBNQ96SW2 442 aa5.06□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 SETDB2Q96T68 719 aa5.06□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 MKNK1Q9BUB5 465 aa5.06□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 USP44Q9H0E7 712 aa5.06□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa5.06□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 PSME4Q14997 1843 aa5.06□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 SLX4Q8IY92 1834 aa5.06□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 MAST2Q6P0Q8 1798 aa5.06□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 PDE8AO60658 829 aa5.05□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 GNAI3P08754 354 aa5.05□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 ATP4AP20648 1035 aa5.05□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 KCNA3P22001 575 aa5.05□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 TGFB2P61812 414 aa5.05□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 FOXO4P98177 505 aa5.05□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 EPHA10Q5JZY3 1008 aa5.05□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 CEP85Q6P2H3 762 aa5.05□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 SYNE4Q8N205 404 aa5.05□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 VWA5B2Q8N398 1253 aa5.05□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa5.05□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 RHPN1Q8TCX5 695 aa5.05□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 FAM89AQ96GI7 184 aa5.05□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 PHACTR1Q9C0D0 580 aa5.05□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa5.05□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 GJA3Q9Y6H8 435 aa5.05□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 FAM177BA6PVY3 158 aa5.04□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 H3BM21 787 aa5.04□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 GNAI2P04899 355 aa5.04□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 CSF1RP07333 972 aa5.04□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 SRGNP10124 158 aa5.04□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 HSPA6P17066 643 aa5.04□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 AAMPQ13685 434 aa5.04□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 OCLNQ16625 522 aa5.04□□□□□ -1.6
CTPS1-212ENST00000498694 EFHC2Q5JST6 749 aa5.04□□□□□ -1.6
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