RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489835.6

PRRT4-205, Transcript of proline rich transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4-205ENST00000489835 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PRRT4-205ENST00000489835 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PRRT4-205ENST00000489835 CNPY2Q9Y2B0 182 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRT4-205ENST00000489835 H3BQV1 296 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRT4-205ENST00000489835 TPRNQ4KMQ1 711 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRT4-205ENST00000489835 IFFO2Q5TF58 517 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRT4-205ENST00000489835 NUP133Q8WUM0 1156 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRT4-205ENST00000489835 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PRRT4-205ENST00000489835 USP40Q9NVE5 1235 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRT4-205ENST00000489835 LAMB1P07942 1786 aa20.14■□□□□ 0.82
PRRT4-205ENST00000489835 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
PRRT4-205ENST00000489835 CRKP46108 304 aa20.14■□□□□ 0.82
PRRT4-205ENST00000489835 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.82
PRRT4-205ENST00000489835 TGFB2P61812 414 aa20.14■□□□□ 0.82
PRRT4-205ENST00000489835 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
PRRT4-205ENST00000489835 TEKT1Q969V4 418 aa20.14■□□□□ 0.82
PRRT4-205ENST00000489835 TSPY2A6NKD2 308 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 ORC4O43929 436 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 IQCA1Q86XH1 822 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 AMOTL1Q8IY63 956 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 PHKBQ93100 1093 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 MKNK2Q9HBH9 465 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 GJB4Q9NTQ9 266 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 PCP11498 1178 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 CERS3Q8IU89 383 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 CCDC82Q8N4S0 544 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 TMEM87AQ8NBN3 555 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 MAP7D2Q96T17 732 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 NAV1Q8NEY1 1877 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 RAD17O75943 681 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 SASS6Q6UVJ0 657 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF654Q8IZM8 581 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 KIF13BQ9NQT8 1826 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 UBE2Q2LH0YL09 131 aa20.12■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 TFAP4Q01664 338 aa20.12■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 HHIPL2Q6UWX4 724 aa20.12■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 CACNB3P54284 484 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 TMTC2Q8N394 836 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 AIFM3Q96NN9 605 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 PSMD1Q99460 953 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 DYNC1I1O14576 645 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 FIBPO43427 364 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 NTRK3Q16288 839 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 SGIP1Q9BQI5 828 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 MTA3Q9BTC8 594 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 MYH1P12882 1939 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 NFIAQ12857 509 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 UVSSAQ2YD98 709 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 KIF3AQ9Y496 699 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 COL4A5P29400 1685 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 CDK8P49336 464 aa20.09■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 RTN1Q16799 776 aa20.09■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 CCDC183Q5T5S1 534 aa20.09■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 IL17RBQ9NRM6 502 aa20.09■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 FANCBQ8NB91 859 aa20.09■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 PSMD14O00487 310 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 SLURP2P0DP57 97 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 PTGER2P43116 358 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 TCP10Q12799 353 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 GRIPAP1Q4V328 841 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 ZFPM1Q8IX07 1006 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 ZDHHC15Q96MV8 337 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 SLC26A6Q9BXS9 759 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 BCS1LQ9Y276 419 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PRRT4-205ENST00000489835 TSPY3P0CV98 308 aa20.08■□□□□ 0.8
PRRT4-205ENST00000489835 TSPY8P0CW00 308 aa20.08■□□□□ 0.8
PRRT4-205ENST00000489835 RASA1P20936 1047 aa20.08■□□□□ 0.8
PRRT4-205ENST00000489835 IARSP41252 1262 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
PRRT4-205ENST00000489835 UBE2HP62256 183 aa20.08■□□□□ 0.8
PRRT4-205ENST00000489835 RESTQ13127 1097 aa20.08■□□□□ 0.8
PRRT4-205ENST00000489835 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
PRRT4-205ENST00000489835 C8orf76Q96K31 380 aa20.08■□□□□ 0.8
PRRT4-205ENST00000489835 ROBO3Q96MS0 1386 aa20.08■□□□□ 0.8
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
PRRT4-205ENST00000489835 RCSD1Q6JBY9 416 aa20.07■□□□□ 0.8
PRRT4-205ENST00000489835 C16orf86Q6ZW13 317 aa20.07■□□□□ 0.8
PRRT4-205ENST00000489835 CATIPQ7Z7H3 387 aa20.07■□□□□ 0.8
PRRT4-205ENST00000489835 CDKL5O76039 1030 aa20.06■□□□□ 0.8
PRRT4-205ENST00000489835 ALG1Q9BT22 464 aa20.06■□□□□ 0.8
PRRT4-205ENST00000489835 USP25Q9UHP3 1055 aa20.06■□□□□ 0.8
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