RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484726.5

BNC2-208, Transcript of basonuclin 2, human

TSL 5

Gene BNC2, Length 4,841 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BNC2-208	ENST00000484726	GPS2	Q13227	327 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	WTAP	Q15007	396 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	SPEF2	Q9C093	1822 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	CDC27	P30260	824 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	LONRF3	Q496Y0	759 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	MLKL	Q8NB16	471 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	DPF2	Q92785	391 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	RGPD5	Q99666	1765 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	BBOX1	O75936	387 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	MMP10	P09238	476 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	PDE6A	P16499	860 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	FAM193A	P78312	1265 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	GSTO1	P78417	241 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	PTPN21	Q16825	1174 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	HPSE	Q9Y251	543 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	BCS1L	Q9Y276	419 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	NEDD4	P46934	1319 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	TMEM232	C9JQI7	657 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	MBD4	O95243	580 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	CTSW	P56202	376 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	OGFOD1	Q8N543	542 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	LAMA4	Q16363	1823 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	SOCS7	O14512	581 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	MASTL	Q96GX5	879 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	GREM2	Q9H772	168 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	RAI14	Q9P0K7	980 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	SLFN14	P0C7P3	912 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	NF2	P35240	595 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	CCDC93	Q567U6	631 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	MSL1	Q68DK7	614 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	NIM1K	Q8IY84	436 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	STK36	Q9NRP7	1315 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	PTPA	Q15257	358 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	HOOK2	Q96ED9	719 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	FOXP2	O15409	715 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	STX10	O60499	249 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	DEXI	O95424	95 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	CCDC175	P0C221	793 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	KIF5C	O60282	957 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	TMTC2	Q8N394	836 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	TTLL6	Q8N841	843 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	GOLGA1	Q92805	767 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	MAP3K14	Q99558	947 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	ARMT1	Q9H993	441 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	LY9	Q9HBG7	655 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	BCL9	O00512	1426 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	BTBD18	B2RXH4	712 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	MMP1	P03956	469 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	11.61	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	GGA1	Q9UJY5	639 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	GNAT2	P19087	354 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	LIFR	P42702	1097 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BNC2-208	ENST00000484726	PHKA1	P46020	1223 aa		11.61	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms