RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482278.5

TUBGCP2-208, Transcript of tubulin gamma complex associated protein 2, human

TSL 2

Gene TUBGCP2, Length 3,553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF202	O95125	648 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PRDX5	P30044	214 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HSPA1L	P34931	641 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LIFR	P42702	1097 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KRT23	Q9C075	422 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NYX	Q9GZU5	481 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NMT2	O60551	498 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NR5A1	Q13285	461 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LAMB2	P55268	1798 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CDKL5	O76039	1030 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	YEATS4	O95619	227 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GRIN1	Q05586	938 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TNKS	O95271	1327 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RTN1	Q16799	776 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SHC4	Q6S5L8	630 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	OXER1	Q8TDS5	423 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CYP2D6	P10635	497 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SHISA4	Q96DD7	197 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CACNA1S	Q13698	1873 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	BECN2	A8MW95	431 aa		13.52	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GNAT2	P19087	354 aa		13.52	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MECOM	Q03112	1051 aa		13.52	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TRIM29	Q14134	588 aa		13.52	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NFIX	Q14938	502 aa		13.52	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC39A14	Q15043	492 aa		13.52	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PTPA	Q15257	358 aa		13.52	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MAP3K14	Q99558	947 aa		13.52	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		13.52	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		13.52	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278		A0A1B0GUL6	1792 aa		13.52	□□□□□ -0.24
TUBGCP2-208	ENST00000482278		A0A1W2PQ27	194 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278		A0A1W2PQ64	194 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278		A0A1W2PQD8	194 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FAM205C	A6NFA0	338 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KCNA4	P22459	653 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TM4SF1	P30408	202 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ERICH2	A1L162	156 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	USP17L12	C9JPN9	530 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	USP17L21	D6R901	530 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CTAGE5	O15320	804 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NBPF11	Q86T75	865 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FANCB	Q8NB91	859 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FOXN1	O15353	648 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TEX35	Q5T0J7	233 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	IFNAR1	P17181	557 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PNOC	Q13519	176 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CTR9	Q6PD62	1173 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DEF6	Q9H4E7	631 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ANO10	Q9NW15	660 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PTPN21	Q16825	1174 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SEC23A	Q15436	765 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CMA1	P23946	247 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SYK	P43405	635 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GRIK5	Q16478	980 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MMP1	P03956	469 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		13.49	□□□□□ -0.25

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