RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CEP128Q6ZU80 1094 aa19.13■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC52A2Q9HAB3 445 aa19.13■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 E7EVH7 732 aa19.12■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NBPF14Q5TI25 921 aa19.12■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UBL4BQ8N7F7 174 aa19.12■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KIFAP3Q92845 792 aa19.12■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PLXNC1O60486 1568 aa19.12■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CEP104O60308 925 aa19.12■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF131P52739 623 aa19.12■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TAOK1Q7L7X3 1001 aa19.12■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa19.12■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BRD1O95696 1058 aa19.12■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC14Q49A88 953 aa19.12■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZSCAN26Q16670 478 aa19.12■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa19.12■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GPIHBP1Q8IV16 184 aa19.12■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CLUL1Q15846 466 aa19.11■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TTC38Q5R3I4 469 aa19.11■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 V9GY48 417 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 VGLL3A8MV65 326 aa19.11■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TIMM10P62072 90 aa19.11■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 JAK2O60674 1132 aa19.11■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAGEA1P43355 309 aa19.11■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MIPOL1Q8TD10 442 aa19.11■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CALUO43852 315 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 VSIG1Q86XK7 387 aa19.11■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SMC1BQ8NDV3 1235 aa19.11■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NELFBQ8WX92 580 aa19.11■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PLCG2P16885 1265 aa19.1■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF365Q70YC5 407 aa19.1■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARMT1Q9H993 441 aa19.1■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ADKP55263 362 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa19.1■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CFAP221Q4G0U5 840 aa19.1■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa19.1■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DBNDD2Q9BQY9 259 aa19.1■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PNOCQ13519 176 aa19.1■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP19.1■□□□□ 0.654e-7■■■■■ 27.1
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa19.09■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MCUR1Q96AQ8 359 aa19.09■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CLGNO14967 610 aa19.09■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 JAG2Q9Y219 1238 aa19.09■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LDHBP07195 334 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HSPA1LP34931 641 aa19.09■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BRD3Q15059 726 aa19.09■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WDR44Q5JSH3 913 aa19.09■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ROBO2Q9HCK4 1378 aa19.09■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CROCCP2Q86T23 111 aa19.08■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KLHDC4Q8TBB5 520 aa19.08■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PHKBQ93100 1093 aa19.08■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HDAC9Q9UKV0 1011 aa19.08■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TXKP42681 527 aa19.08■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MTMR3Q13615 1198 aa19.08■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa19.08■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRT40Q6A162 431 aa19.08■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TSKSQ9UJT2 592 aa19.08■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa19.08■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POLD1P28340 1107 aa19.08■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM87AQ8NBN3 555 aa19.08■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 VCX3BQ9H321 246 aa19.08■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRIM35Q9UPQ4 493 aa19.08■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CETN3O15182 167 aa19.08■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PLCB1Q9NQ66 1216 aa19.08■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BABAM1Q9NWV8 329 aa19.08■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A1BGP04217 495 aa19.07■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BIRC3Q13489 604 aa19.07■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 VPS52Q8N1B4 723 aa19.07■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MYL10Q9BUA6 226 aa19.07■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ASIC3Q9UHC3 531 aa19.07■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ODF2LQ9ULJ1 636 aa19.07■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EYA2O00167 538 aa19.07■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SEPT14Q6ZU15 432 aa19.07■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa19.07■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SARNPP82979 210 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HHATQ5VTY9 493 aa19.07■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP19.07■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa19.07■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GPAA1O43292 621 aa19.07■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BLZF1Q9H2G9 400 aa19.07■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM204AQ9H8W3 233 aa19.07■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GPCPD1Q9NPB8 672 aa19.07■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RPS6KA1Q15418 735 aa19.06■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC62Q6P9F0 684 aa19.06■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 APPBP2Q92624 585 aa19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms