RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
SH3BP4-207ENST00000454947 TTC14Q96N46 770 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP4-207ENST00000454947 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP11.1□□□□□ -0.63
SH3BP4-207ENST00000454947 AGXT2Q9BYV1 514 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP4-207ENST00000454947 CREBZFQ9NS37 354 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP4-207ENST00000454947 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
SH3BP4-207ENST00000454947 RPS6KB1P23443 525 aa11.09□□□□□ -0.63
SH3BP4-207ENST00000454947 PDE4BQ07343 736 aa11.09□□□□□ -0.63
SH3BP4-207ENST00000454947 RABEP1Q15276 862 aa11.09□□□□□ -0.63
SH3BP4-207ENST00000454947 MAP3K11Q16584 847 aa11.09□□□□□ -0.63
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa11.09□□□□□ -0.63
SH3BP4-207ENST00000454947 MFSD6Q6ZSS7 791 aa11.09□□□□□ -0.63
SH3BP4-207ENST00000454947 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
SH3BP4-207ENST00000454947 NCOA7Q8NI08 942 aa11.09□□□□□ -0.63
SH3BP4-207ENST00000454947 NEK1Q96PY6 1258 aa11.09□□□□□ -0.63
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF341Q9BYN7 854 aa11.09□□□□□ -0.63
SH3BP4-207ENST00000454947 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF287Q9HBT7 754 aa11.09□□□□□ -0.63
SH3BP4-207ENST00000454947 INCENPQ9NQS7 918 aa11.09□□□□□ -0.63
SH3BP4-207ENST00000454947 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
SH3BP4-207ENST00000454947 MYH8P13535 1937 aa11.09□□□□□ -0.63
SH3BP4-207ENST00000454947 DOCK1Q14185 1865 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM196BA6NMK8 535 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 PRDM1O75626 825 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 PSMA5P28066 241 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 HUNKP57058 714 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 JAG1P78504 1218 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 PRKG1Q13976 671 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 DLK2Q6UY11 383 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 CYB5R4Q7L1T6 521 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP11.08□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 NEDD1Q8NHV4 660 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 ANKS1AQ92625 1134 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 ESR2Q92731 530 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 CCDC17Q96LX7 622 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 KRT23Q9C075 422 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 GINM1Q9NU53 330 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 CSADQ9Y600 493 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 UNCXA6NJT0 531 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 B4E1Z4 1266 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 KDM4AO75164 1064 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 AKR1B1P15121 316 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 GUCY1A2P33402 732 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 EVCP57679 992 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 SEC23AQ15436 765 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 RCSD1Q6JBY9 416 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 RUFY3Q7L099 469 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 KLRG1Q96E93 195 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 IL17RBQ9NRM6 502 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 ZSWIM5Q9P217 1185 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 ATAD5Q96QE3 1844 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 NID2Q14112 1375 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 CASTP20810 708 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 MCM5P33992 734 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 CAP2P40123 477 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 ECE1P42892 770 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 TRDNQ13061 729 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 CST9Q5W186 159 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 SGMS1Q86VZ5 419 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 WRNIP1Q96S55 665 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 TLL2Q9Y6L7 1015 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 PHIPQ8WWQ0 1821 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 PRC1O43663 620 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 USP2O75604 605 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 CPA1P15085 419 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 LIFRP42702 1097 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 DEFB115Q30KQ5 88 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 LDLRAD1Q5T700 205 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM179Q6ZVK1 233 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 MIGA2Q7L4E1 593 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 SAPCD2Q86UD0 394 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 SIAH1Q8IUQ4 282 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 HHIPL1Q96JK4 782 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM87BQ96K49 555 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 LY9Q9HBG7 655 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 MKNK2Q9HBH9 465 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 TNKSO95271 1327 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-207ENST00000454947 UBE2Q2LH0YL09 131 aa11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 203.4 ms