RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427644.1

LIMD1-AS1-201, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMD1-AS1, Length 1,536 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CNNM2Q9H8M5 875 aa11.54□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LY9Q9HBG7 655 aa11.54□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LMBRD1Q9NUN5 540 aa11.54□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NAV1Q8NEY1 1877 aa11.54□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PTPDC1A2A3K4 754 aa11.53□□□□□ -0.56
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GOLGA8BA8MQT2 603 aa11.53□□□□□ -0.56
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF287Q9HBT7 754 aa11.53□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TOMM22Q9NS69 142 aa11.53□□□□□ -0.56
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GPC2Q8N158 579 aa11.52□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MTMR14Q8NCE2 650 aa11.52□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa11.52□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa11.52□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MCM9Q9NXL9 1143 aa11.52□□□□□ -0.57
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa11.52□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FOCADQ5VW36 1801 aa11.52□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ECM29Q5VYK3 1845 aa11.52□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SBF1O95248 1867 aa11.52□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GOLGA6L22H0YM25 854 aa11.51□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PRDM1O75626 825 aa11.51□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FGRP09769 529 aa11.51□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PTMSP20962 102 aa11.51□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RHBDL3P58872 404 aa11.51□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PDE4BQ07343 736 aa11.51□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DPY19L2Q6NUT2 758 aa11.51□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TTC6Q86TZ1 520 aa11.51□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TAOK2Q9UL54 1235 aa11.51□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa11.51□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FLT1P17948 1338 aa11.5□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 H7C1D1 291 aa11.5□□□□□ -0.57
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 APOA5Q6Q788 366 aa11.5□□□□□ -0.57
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SGMS1Q86VZ5 419 aa11.5□□□□□ -0.57
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CDC27P30260 824 aa11.5□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PRELPP51888 382 aa11.5□□□□□ -0.57
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FERMT3Q86UX7 667 aa11.5□□□□□ -0.57
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MYL10Q9BUA6 226 aa11.5□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IDI2Q9BXS1 227 aa11.5□□□□□ -0.57
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MYOZ2Q9NPC6 264 aa11.5□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CNPY2Q9Y2B0 182 aa11.5□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF541Q9H0D2 1346 aa11.49□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZBTB43O43298 467 aa11.49□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ORC4O43929 436 aa11.49□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ENTPD3O75355 529 aa11.49□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ADD1P35611 737 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TNNI2P48788 182 aa11.49□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP11.49□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PICALMQ13492 652 aa11.49□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TNFAIP1Q13829 316 aa11.49□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GSE1Q14687 1217 aa11.49□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 WTAPQ15007 396 aa11.49□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SART3Q15020 963 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C12orf60Q5U649 245 aa11.49□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CDAN1Q8IWY9 1227 aa11.49□□□□□ -0.57
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa11.49□□□□□ -0.57
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