RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 USP17L21D6R901 530 aa30.02■■■□□ 2.4
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 GINM1Q9NU53 330 aa30.01■■■□□ 2.39
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 GIMAP6Q6P9H5 292 aa29.97■■■□□ 2.39
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 AS3MTQ9HBK9 375 aa29.97■■■□□ 2.39
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 GNAT2P19087 354 aa29.96■■■□□ 2.39
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 ABCB5Q2M3G0 1257 aa29.96■■■□□ 2.39
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 SBK1Q52WX2 424 aa29.95■■■□□ 2.39
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SH3D19Q5HYK7 790 aa29.95■■■□□ 2.39
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 MTMR2Q13614 643 aa29.94■■■□□ 2.38
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RILPL2Q969X0 211 aa29.94■■■□□ 2.38
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 A0A0D9SFI3 127 aa29.92■■■□□ 2.38
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 RAB3GAP1Q15042 981 aa29.92■■■□□ 2.38
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C17orf99Q6UX52 265 aa29.92■■■□□ 2.38
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 CD99L2Q8TCZ2 262 aa29.91■■■□□ 2.38
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 CPA4Q9UI42 421 aa29.91■■■□□ 2.38
HOXD-AS2-201ENST00000426965 USP17L10C9JJH3 530 aa29.9■■■□□ 2.38
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AKR1B1P15121 316 aa29.9■■■□□ 2.38
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 IFFO2Q5TF58 517 aa29.9■■■□□ 2.38
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ACER1Q8TDN7 264 aa29.9■■■□□ 2.38
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 VPS53Q5VIR6 699 aa29.89■■■□□ 2.38
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ABHD8Q96I13 439 aa29.89■■■□□ 2.38
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C19orf81C9J6K1 198 aa29.88■■■□□ 2.37
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SDSP20132 328 aa29.88■■■□□ 2.37
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ERO1AQ96HE7 468 aa29.88■■■□□ 2.37
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EMILIN3Q9NT22 766 aa29.88■■■□□ 2.37
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ROBO3Q96MS0 1386 aa29.88■■■□□ 2.37
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa29.87■■■□□ 2.37
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TTC22Q5TAA0 569 aa29.86■■■□□ 2.37
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM179Q6ZVK1 233 aa29.86■■■□□ 2.37
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
HOXD-AS2-201ENST00000426965 STK11IPQ8N1F8 1099 aa29.86■■■□□ 2.37
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NACAP1Q9BZK3 213 aa29.86■■■□□ 2.37
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMOD4Q9NZQ9 345 aa29.86■■■□□ 2.37
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BCRP11274 1271 aa29.85■■■□□ 2.37
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