RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 TCEANC2Q96MN5 208 aa19.95■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa19.95■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 LAMB1P07942 1786 aa19.94■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM47AQ5JRC9 791 aa19.94■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMTC2Q8N394 836 aa19.94■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 NKX2-3Q8TAU0 364 aa19.94■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 RRAGCQ9HB90 399 aa19.94■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa19.93■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 LIFRP42702 1097 aa19.93■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa19.93■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM67Q5HYA8 995 aa19.93■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 DCAF15Q66K64 600 aa19.93■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRT26Q7Z3Y9 468 aa19.93■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDAN1Q8IWY9 1227 aa19.93■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 NEDD1Q8NHV4 660 aa19.93■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa19.93■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa19.93■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLIN4Q96Q06 1357 aa19.92■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 SCN4AP35499 1836 aa19.92■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa19.92■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 BRF1Q92994 677 aa19.92■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRRC2Q9BYS8 371 aa19.92■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 TBC1D2Q9BYX2 928 aa19.92■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM196BA6NMK8 535 aa19.91■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDC37L1Q7L3B6 337 aa19.91■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 DGKHQ86XP1 1220 aa19.91■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 LY9Q9HBG7 655 aa19.91■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 TNKSO95271 1327 aa19.91■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 EVCP57679 992 aa19.9■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 WTAPQ15007 396 aa19.9■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 SEC23AQ15436 765 aa19.9■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 MIGA2Q7L4E1 593 aa19.9■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 SGMS1Q86VZ5 419 aa19.9■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa19.9■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLEC11AQ9Y240 323 aa19.9■□□□□ 0.78
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLURP2P0DP57 97 aa19.89■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 AKR1B1P15121 316 aa19.89■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABCB5Q2M3G0 1257 aa19.89■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 LDHDQ86WU2 507 aa19.89■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANKS1AQ92625 1134 aa19.89■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 CABP5Q9NP86 173 aa19.89■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 IL17RBQ9NRM6 502 aa19.89■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa19.88■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC69A6NI79 296 aa19.88■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADM5C9JUS6 153 aa19.88■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 NFXL1Q6ZNB6 911 aa19.88■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM179Q6ZVK1 233 aa19.88■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 USP48Q86UV5 1035 aa19.88■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF341Q9BYN7 854 aa19.88■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 NMRK2Q9NPI5 230 aa19.88■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 GINM1Q9NU53 330 aa19.88■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 TPCN1Q9ULQ1 816 aa19.88■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYH1P12882 1939 aa19.88■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 NMT2O60551 498 aa19.87■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 NOVP48745 357 aa19.87■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 APOBRQ0VD83 1088 aa19.87■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa19.87■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMX3Q96JJ7 454 aa19.87■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP19.87■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 KANSL2Q9H9L4 492 aa19.87■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 MTMR4Q9NYA4 1195 aa19.87■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa19.86■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 PHF20L1A8MW92 1017 aa19.86■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 NF2P35240 595 aa19.86■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 CAP2P40123 477 aa19.86■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 RCAN1P53805 252 aa19.86■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 RCSD1Q6JBY9 416 aa19.86■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa19.86■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHMP4CQ96CF2 233 aa19.86■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 CEP95Q96GE4 821 aa19.86■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF112Q9UJU3 913 aa19.86■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC12A7Q9Y666 1083 aa19.86■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 GDF11O95390 407 aa19.85■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 POTEIP0CG38 1075 aa19.85■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 POTEJP0CG39 1038 aa19.85■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDCA5Q96FF9 252 aa19.85■□□□□ 0.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.2 ms